研究者たちは、微生物による食品の安全性を考慮する方法を変えるよう求めている。
クアドラム研究所、イースト・アングリア大学、王立獣医大学、マッシー大学の専門家らは、微生物群集全体および食物連鎖全体におけるリスクを評価し、変化を監視する、より総合的なアプローチを求めている。
彼らは、細菌の脅威や危険が出現したときに先手を打つために、ゲノム監視の導入が拡大することを望んでいます。
科学者たちは、政府や国際機関に対し、ゲノムに基づく監視に資源を投入するよう求めた。現在、そのような監視のほとんどは、十分な資源のある地域で行われているが、将来のショックに対して食品供給チェーンを強靭にするには、世界的な対応が必要だと、科学者たちは記事の中で述べた。 ネイチャーレビュー微生物学。
これまでは健康リスクをもたらすことが知られている個々の細菌種に焦点が当てられる傾向があったが、細菌は複雑であり、相互作用する微生物群集として存在していると専門家は述べている。
解決策の一部
研究チームは、全ゲノム配列解析とメタゲノミクスが、微生物監視計画や食品システムからの洞察と組み合わせることで、リスクに対処し、サプライチェーン全体で新たな食品安全介入を実施するための情報を当局や企業に提供できる有用なツールであると強調した。
メタゲノミクスは、特定の環境に何が存在するかの全体像を示します。遺伝子指紋は、遺伝的に同一の細菌株を結び付けて、発生源を特定するのに役立ちます。また、問題のある細菌株がいつ、どのように発生したかを追跡することもできます。
一例として、カンピロバクターの予防と管理において、食物連鎖を通じて細菌の伝染を追跡・追跡し、また発生源の特定・判定にも役立つゲノム配列解析ツールの使用がいかに役立っているかが挙げられた。
「こうした監視システムで重要なのは、感度だけでなく適時性だ。そうすれば、情報を使って事件が起きてから対応するよりも、食中毒を防ぐための予防措置を講じることができる」とクアドラム研究所のアリソン・マザー教授は語った。
監視を改善するためのデータの増加
科学者たちは、最も危険な細菌種が何であるか、そしてそれが健康にどのような影響を及ぼす可能性があるかはよく知られていると述べた。しかし、これらの細菌がどのようにして、そしてどこで、ますますグローバル化が進む食品システムに入り込み、存続し、進化するかについては、あまりよくわかっていない。また、他にどのような細菌病原体が病気を引き起こしているのに検出されないのだろうか？
こうした知識のギャップにより、食中毒を減らすための介入策を開発することが困難になっています。気候変動、技術革新、その他の地政学的出来事などの地球規模の要因が、食品システム内の細菌プロファイルをどのように変えるかを理解する必要があります。
より幅広く多様な情報源から得られるゲノムおよびメタゲノムデータが増えることで、監視が改善され、脅威をより適切に検出できるようになります。ゲノムに基づくアプローチにより、細菌による食中毒の進化と拡大に関する理解も深まりました。
「企業は、ゲノミクスによって非常に詳細な情報が得られることを理解しており、ありがたいことに、その技術的な可能性と、食品安全リスクの管理に役立つ有意義な新しいソリューションを組み合わせることができます」と、クアドラム研究所のマシュー・ギルモア氏は語った。
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