抽象的な
直接的なRNAナノポアシーケンスデータは、原発性ヒト気管支上皮細胞のインフルエンザウイルス曝露に応答した遺伝子発現、ポリアデニル化、スプライシング、M6Aメチル化、および擬似ルジル化の変化を明らかにします。この研究では、宿主免疫応答における遺伝子のエピトランスクリプトームプロファイルに焦点を当てています。ポリアデニル化非コーディングRNAに加えて、これらの新規RNAで発現、N6-メチルアデノシン（M6A）、およびシュードリジル化（ψ）の発現の変化を観察し、発現の変化を観察しました。免疫応答に役割を伴う最近発見された2つのLincrNA、ChaserrとLeadRは、シーケンスデータの分析で、インフルエンザ曝露に応じて高度にメチル化されると予測されています。擬似性ガイドに反応して、偽スリジル化を導くいくつかのH/ACA型角は発現が減少し、2つの新規LNCRNAの擬似ルイジル化には対応する予測される減少があります。したがって、ナノポアテクノロジーを使用した直接的なRNAシーケンスによって明らかにされた新しいエピトルンスクリプトームの変化は、インフルエンザウイルス曝露に反応する上皮遺伝子ネットワークの宿主エピトランシプトムの変化に関するユニークな洞察を提供します。
競合する利息声明
著者は、競合する関心を宣言していません。
資金提供者情報が宣言されました
国立衛生研究所、P20GM103648、P30GM149368
退役軍人局、I01 BX005023
客室乗務員医学研究所、113052
長老派ヘルス財団
オクラホマ大学ドッジファミリーカレッジオブアーツアンドサイエンス
国立科学財団、2023310
#ナノポア直接RNAシーケンスはヒト気管支上皮細胞の転写景観のウイルス誘発性の変化を明らかにします