雑誌に掲載された最近の研究では 自然の老化研究者らは、長期コホート研究において、多遺伝子リスクスコア（PRS）と腸内マイクロバイオームスコアを一般的な疾患の従来の危険因子と統合することによる付加的予測値を評価した。
分析： 一般的な疾患に対する多遺伝子リスク予測と腸内メタゲノムリスク予測の統合。 画像クレジット:remotevfx.com / Shutterstock
背景
マルチオミクス技術は、ゲノムデータとマイクロバイオミクスデータを統合することで病気の予測を変革し、心臓病、糖尿病、がんなどの加齢に関連する症状に対する新たな洞察を提供します。 以前は、リスク評価は主に人口統計、ライフスタイル、臨床指標に依存していました。 現在、PRS と腸内マイクロバイオーム分析をリスクモデルに統合することで、従来の要因を超えて予測精度が向上することが期待されています。 PRS は費用対効果の高い遺伝的素因指標を提供し、腸内マイクロバイオームは疾患リスクの理解に新たな側面を追加します。 この新しいアプローチでは、その精度を磨き、さまざまな人々や医療システムにわたってその有効性を確保するためにさらなる研究が必要です。
研究について
1972 年以来慢性疾患の危険因子を調査することを目的としたフィンランドの一連の調査の一部である FINRISK 2002 コホートは、腸内細菌叢と健康転帰との相互作用に焦点を当てたこの研究の基礎として機能しました。 フィンランドの 6 つの地域にまたがるこのコホートには、25 ～ 74 歳の多様な層を含む 13,498 人の招待者の中から 8,783 人の参加者が集まりました。 厳格な倫理ガイドラインに基づいて、これらの参加者は包括的な健康診断を受け、血液や便などの生体サンプルを提供しました。
この研究は、詳細なベースラインデータ収集に基づいており、冠動脈疾患（CAD）、2型糖尿病（T2D）、アルツハイマー病（AD）、前立腺などの疾患に対する従来のリスク指標と並行して、遺伝的および微生物学的要因の予測力を調査することを目的としています。癌。 この研究では、慎重なサンプル処理と最先端のゲノムおよびメタゲノム分析を通じて、高度なマルチオミクス技術を活用して予測モデルを構築しました。 これらのモデルは、従来のリスク評価ツールと比較して予測パフォーマンスを評価する、厳密な統計的手法を通じて改良されました。
研究結果
電子健康記録（EHR）を含む17.8年にわたる縦断研究であるFINRISK 2002コホートでは、帰属遺伝子型と消化管疾患の両方を有する参加者の間でT2D 579例、CAD 333例、AD 273例、前立腺がん141例が特定された。メタゲノム配列決定。 ベースラインの臨床危険因子は、CAD、T2D、および AD の発症症例と非症例の間に有意な差を示し、T2D および性別、拡張期血圧 (DBP)、AD の高密度リポタンパク質 (HDL) などの特定の因子が含まれていました。大きくは変わらない。 前立腺がんの症例は、ベースライン年齢と喫煙習慣の点で非症例と大きく異なりました。
PRS および従来の危険因子は、Cox 回帰モデルを通じて、偶発疾患の予測性能について評価されました。 この分析により、PRS を個別に評価するか、従来の危険因子と組み合わせて評価すると、発症疾患と有意な相関があり、ベースラインの臨床危険因子のみを超えて予測性能が向上することが明らかになりました。 特に、CAD、T2D、前立腺がんなどの疾患では、PRS は従来の家族歴指標に比べて明らかな利点を提供し、既存のリスク評価モデルを補完する可能性を強調しました。
T2Dの核磁気共鳴（NMR）によって測定される血糖値などの追加の危険因子を調査する部分解析は、PRSの予測値を一貫して支持しました。 腸内マイクロバイオームも重要な因子として浮上しており、ベースラインでのその組成は偶発疾患と相関しています。 この研究では、腸内微生物叢の多様性と病気の発生率との関連を詳しく調べ、病気の予測モデルを強化する可能性がある特定のパターンを発見しました。
この研究は、多遺伝子因子、メタゲノム因子、および従来の因子を、偶発疾患を予測するための一貫したモデルに統合する可能性を強調しました。 PRS および腸内マイクロバイオームスコアと従来の危険因子を組み合わせたこのようなモデルは、CAD、T2D、AD、および前立腺がんの予測精度の顕著な向上を示しました。 この統合的なアプローチは、病気の予測を改良し、予防措置をより効果的に調整する上でマルチオミクス データが期待できることを示しています。
サブグループ分析により、PRS、腸内マイクロバイオームスコア、疾患発生率間の有意な関連性が再確認され、さまざまな症状にわたるこれらの要因の寄与が強調されました。
結論
要約すると、この研究は、追跡調査中央値17.8年にわたって、十分に確立されたPRS、ベースラインの腸内マイクロバイオーム、および従来の危険因子の予測力を対比させたものである。 調査結果は、年齢がCAD、AD、および前立腺がんに対して最も影響力のある個人の危険因子である一方で、PRSと腸内マイクロバイオームスコアを含めることで予測精度が著しく向上することを明らかにしました。 PRS だけでも高い疾患発生率と有意に相関しており、従来のリスク評価を強化する可能性があることが強調されています。 さらに、この研究は、PRS が家族歴から確立されたリスクへの影響を超えて、CAD、T2D、および前立腺がんの予測を精緻化できることを示唆しています。 腸内マイクロバイオームの予測への寄与は控えめに見えますが、従来の要因と組み合わせると、病気の予測を強化することが期待できます。 この分析は、さまざまな条件にわたる腸内マイクロバイオームの微妙な役割を指摘しており、その予測値が宿主の老化と微生物の変化の間の複雑な相互作用によって異なる可能性があることを示唆しています。
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#マルチオミクスアプローチにより従来の方法を超えて疾患予測の精度が向上
2024-03-27 02:41:00