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科学者は、形を変える可能性のあるタンパク質を設計します

新しい動きで、研究者は、タンパク質設計ソフトウェアがその出力に動きを組み込むことができることを示しました。 結果として生じるタンパク質は、片方の腕で波を与えます カルシウムイオンを拘束して放出すると（科学 2025、doi：10.1126/science.adr7094）。 この作業は、特にコンピューティングパワーが増加するにつれて、シーケンスからタンパク質構造を予測する能力やその逆の能力を含む、深い学習を備えたタンパク質設計の進歩に基づいています。 新しい柔軟なfoldを作るために、博士課程の学生であるエイミー・グー Tanja Kortemmeのグループ カリフォルニア大学サンフランシスコ校では、自然に発生する静的なカルシウム結合タンパク質を取り、二次ヘリックス構造に焦点を当てることにより動きでプログラムされました。 Guoは、2つの立体構造を与えるタンパク質に変化を導入しました。1つの状態がカルシウムを結合する状態と、「カルシウム結合部位を不安定にする」1つの状態、つまり本質的にカルシウムを手放します。 ノーベル賞を受賞したAI駆動のタンパク質設計は長い道のりを歩んできましたが、「これらのアルゴリズムが最適化するのは、構造を非常に安定にすることです。 「動的な」タンパク質、または移動できるタンパク質の設計は、設計者が1つの位置で機能するだけでなく複数の構造を考え出さなければならず、タンパク質が位置間を移行できる必要があるため、はるかに困難です。 「以前の研究では、ドメイン全体が再び反応するタンパク質の設計につながりました。他のアプローチは、ドメイン全体がシフトシフトできる変成タンパク質を設計することが可能であることを示しています」と言います。 ジョン・オルバン、メリーランド大学バイオサイエンスおよびバイオテクノロジー研究所の教授であり、C＆enへの電子メールで作業に関与していませんでした。 「この新しい作品はその間のどこかにあり、現在、二次構造要素のドメイン内向きを備えたタンパク質を設計する能力を追加しています。」 Kortemmeは、これらの進歩を使用して、正確に制御できる新しいタンパク質を作成したいと考えています。彼女は特に、エネルギー入力に応じて形を変えることができる完全に新しい「プロテインマシン」を作成することに興味があります。 #科学者は形を変える可能性のあるタンパク質を設計します