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人工知能と遺伝子発現分析を活用して、ウイルス複製と組織向け熱帯に潜在的に関与する可能性のある潜在的なウシコロナウイルス(BCOV)受容体および宿主細胞酵素を特定する

ウシコロナウイルス(BCOV)は、牛の呼吸器と腸管の両方に感染する二重組織へのトロピズムを示します。宿主細胞へのウイルス侵入には、ウイルスタンパク質と宿主タンパク質の間の協調的な相互作用が必要です。ただし、BCOV侵入を促進する特定の細胞受容体と共受容体は、あまり理解されていないままです。同様に、他のコロナウイルスの複製を支援することが知られているFurin、TMPRSS2、Cathepsin-L(CTS-L)などの宿主プロテアーゼの役割は、BCOVについては広範囲に調査されていません。この研究の目的は、ウイルス複製と組織トロピズムを調節する新規BCOV受容体と宿主プロテアーゼを特定することです。ウシ細胞株は、腸内および呼吸器の起源からのBCOV分離株に感染し、感染後の宿主細胞遺伝子発現プロファイルは、次世代シーケンス(NGS)を使用して分析されました。潜在的な受容体とプロテアーゼをコードする差次的に発現した遺伝子は、シリコ内予測と分子ドッキング分析を使用してさらに評価されました。これらの分析は、BCOV感染における潜在的な役割を特定するために、ACE2、NRP1、DPP4、APN、AXL、およびCEACAM1を含む既知のコロナウイルス受容体に焦点を当てていました。これらの発見の検証は、個々の遺伝子を標的とするQRT-PCRアッセイを使用して実行されました。一部のBCOV(+/-)肺組織のこれらの受容体と酵素の遺伝子発現プロファイルを確認しました。結果は、ACE2、DPP4、およびCEACAM1と比較して、9-O-アセチル化シアル酸およびNRP1に対するBCOVスパイクおよびヘマグルチニンエステラーゼ(HE)タンパク質の高い結合親和性を明らかにしました。さらに、FurinとTMPRSS2は、BCOV-Sポリ塩基切断部位(RRSRR | A)と相互作用すると予測され、S糖タンパク質の活性化における役割を示唆しています。これは、BCOVと複数の宿主受容体およびプロテアーゼとの相互作用を調査する最初の研究です。 BCOV感染と複製における役割を確認するために、機能的研究が推奨されます。 キーワード: ACE-2; BCOV;フリン; NPR1; Neu5,9ac2; TMPRRS2;ドッキング;ヘマグルチニンエステラーゼ;相同性モデリング;スパイク糖タンパク質;ウイルス/宿主の相互作用。 #人工知能と遺伝子発現分析を活用してウイルス複製と組織向け熱帯に潜在的に関与する可能性のある潜在的なウシコロナウイルスBCOV受容体および宿主細胞酵素を特定する

人工知能と遺伝子発現分析を活用して、ウイルス複製と組織向け熱帯に潜在的に関与する可能性のある潜在的なウシコロナウイルス(BCOV)受容体および宿主細胞酵素を特定する

ウシコロナウイルス(BCOV)は、牛の呼吸器と腸管の両方に感染する二重組織へのトロピズムを示します。宿主細胞へのウイルス侵入には、ウイルスタンパク質と宿主タンパク質の間の協調的な相互作用が必要です。ただし、BCOV侵入を促進する特定の細胞受容体と共受容体は、あまり理解されていないままです。同様に、他のコロナウイルスの複製を支援することが知られているFurin、TMPRSS2、Cathepsin-L(CTS-L)などの宿主プロテアーゼの役割は、BCOVについては広範囲に調査されていません。この研究の目的は、ウイルス複製と組織トロピズムを調節する新規BCOV受容体と宿主プロテアーゼを特定することです。ウシ細胞株は、腸内および呼吸器の起源からのBCOV分離株に感染し、感染後の宿主細胞遺伝子発現プロファイルは、次世代シーケンス(NGS)を使用して分析されました。潜在的な受容体とプロテアーゼをコードする差次的に発現した遺伝子は、シリコ内予測と分子ドッキング分析を使用してさらに評価されました。これらの分析は、BCOV感染における潜在的な役割を特定するために、ACE2、NRP1、DPP4、APN、AXL、およびCEACAM1を含む既知のコロナウイルス受容体に焦点を当てていました。これらの発見の検証は、個々の遺伝子を標的とするQRT-PCRアッセイを使用して実行されました。一部のBCOV(+/-)肺組織のこれらの受容体と酵素の遺伝子発現プロファイルを確認しました。結果は、ACE2、DPP4、およびCEACAM1と比較して、9-O-アセチル化シアル酸およびNRP1に対するBCOVスパイクおよびヘマグルチニンエステラーゼ(HE)タンパク質の高い結合親和性を明らかにしました。さらに、FurinとTMPRSS2は、BCOV-Sポリ塩基切断部位(RRSRR | A)と相互作用すると予測され、S糖タンパク質の活性化における役割を示唆しています。これは、BCOVと複数の宿主受容体およびプロテアーゼとの相互作用を調査する最初の研究です。 BCOV感染と複製における役割を確認するために、機能的研究が推奨されます。

キーワード:

ACE-2; BCOV;フリン; NPR1; Neu5,9ac2; TMPRRS2;ドッキング;ヘマグルチニンエステラーゼ;相同性モデリング;スパイク糖タンパク質;ウイルス/宿主の相互作用。

#人工知能と遺伝子発現分析を活用してウイルス複製と組織向け熱帯に潜在的に関与する可能性のある潜在的なウシコロナウイルスBCOV受容体および宿主細胞酵素を特定する

執筆者について: nipponese

Nipponese News編集部は、国内外のニュースを日本語で分かりやすくお届けします。