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2024-11-12 09:32:00
ニューヨーク大学の研究者らは、6,000を超えるヒトlncRNAの喪失がHEK293FTと4つのがん細胞株の細胞の適応性にどのような影響を与えたかを調査した。大規模並列スクリーニングでは、RNA 分解性 CRISPR-Cas13 と 75,000 個の gRNA を利用して、DNA 調節要素を破壊することなく lncRNA を正確にノックダウンし、それによって近くのタンパク質コード遺伝子に影響を与えませんでした。
その結果、778 個の必須 lncRNA が明らかになり、そのうち 46 個は普遍的な必須性を示し、700 個以上は細胞特異的な役割を示しました。必須の lncRNA は細胞周期制御およびアポトーシス経路に関連しており、多くの場合、発生初期段階および特定の腫瘍で豊富な発現を示します。
必須 lncRNA の発現レベルと患者の生存との相関を評価するために、9,000 近くの原発腫瘍からのデータが分析されました。このアプローチにより、がんの進行や患者の生存率と相関する lncRNA が同定され、それによって潜在的なバイオマーカーまたは治療標的として機能する可能性があります。
この研究は、lncRNAと隣接するタンパク質コード遺伝子の間の本質性における低い相関関係を明らかにし、それによってlncRNAは主に近くの遺伝子を調節することによって機能するという一般的な仮定に疑問を投げかけた。代わりに、lncRNA は、異なる自律的な機能を備えた独立した制御の役割を果たします。
この研究は、ニューヨークゲノムセンターとニューヨーク大学のネビル・サンジャナ氏が主導したもので、 昨日Cellに掲載されました。
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