全ゲノム配列決定を使用して心臓病におけるタンデムリピートの拡大を調べる初の研究で、小児病院（SickKids）の科学者らは、心筋症の早期発見と将来の精密治療のための基礎を築いた。
心筋症は、最大 500 人に 1 人が罹患する遺伝性の心臓病です。 この状態は心臓の構造と機能に影響を及ぼし、最終的には心不全につながる可能性があります。
SickKids主導の研究は、 eバイオ医学一部の ランセット発見科学は、遺伝的変異の一種であるタンデムリピートが心筋症患者でより頻繁に拡大しており、症例の 4% が原因となる可能性があることを示しています。 タンデム リピート拡張 (TRE) は 60 以上の症状に寄与することが知られており、多くの場合、遺伝的要素が伴います。
「これまで、心筋症へのTREの関与の程度は不明でした」と研究共同責任者の遺伝学・ゲノム生物学プログラムの上級科学者であるライアン・ユエン博士は言う。 「私たちは現在、この病気を発症するリスクが高い人を特定する別の方法を知っており、最終的には臨床医が患者をより早く診断するのに役立つ可能性があります。」
研究チームはまた、DIP2B遺伝子のTREと心筋症の発症リスクの上昇との間に相関関係があることも発見した。 TRE の正確な位置を明らかにすることは、すべての患者に個別のケアを提供する SickKids の運動である Precision Child Health の一環としての精密療法の開発に役立つ可能性があります。
疾患の遺伝学をより深く理解すればするほど、治療の精度が高まり、心筋症や遺伝的要素を持つ他の多くの疾患を持つ人々のケアに情報を提供できるようになります。」
Seema Mital 博士、遺伝学およびゲノム生物学プログラムの上級科学者、心臓病科のスタッフ心臓専門医、SickKids の心臓血管研究責任者
TRE は心筋症介入の新たな標的を提供する
研究チームは心筋症患者1,200人のゲノムを調べた。 ユエン氏のチームは、心臓疾患の病歴のない研究参加者と比較したところ、人ではほとんど拡張されないタンデムリピートが、心筋症患者ではより多く存在することを発見した。 研究者らは、主に心臓、特に酸素を含んだ血液を体内に送り出す役割を担う左心室に影響を与える遺伝子のタンデムリピートに注目した。
研究チームはまた、心筋症を患う親の子供はTREが大きく、これは「遺伝的予期」として知られる現象であることにも気づいた。 TRE が大きくなると、遺伝子の機能が破壊される可能性が高くなります。 TREが大きくなると、発症が早まり、症状が重くなる可能性があるため、科学者はその増殖を軽減する方法を研究しています。
「私たちの最終的な目標は、患者の転帰を改善するために、こうした拡大を阻止または逆転できる方法があるかどうかを確認することです」とユエン氏は言う。 「TRE の背後にあるメカニズムを理解することで、TRE の遺伝的影響を軽減できる可能性があります。」
ユエン氏の研究室とシックキッズの応用ゲノミクスセンター（TCAG）で開発された新しい計算手法により、チームはゲノム配列データを徹底的に調べて、人のゲノム内のTREがどこにどれくらいの大きさであるかを正確に特定することができた。
「全ゲノム配列決定を使用すると、ゲノム全体の TRE を調べて、人の遺伝的素因の全体像を把握するのに役立ちます」と、ユエン研究室の博士研究員であり、この研究の筆頭著者であるアレクサンドラ (サーシャ) ミティナ博士は述べています。
ユエン氏の将来の研究では、この技術を使用して同様の方法を適用してゲノム領域を調査し、科学者が心筋症を超えた症状の治療法を開発するのに役立つ可能性がある。
この研究は、オンタリオ州政府、カナダ保健研究所 (CIHR)、アズリエリ財団、トロント大学マクラフリン センター、テッド ロジャース心臓研究センター、トロント大学データ サイエンス研究所、オンタリオ州心臓脳卒中財団、ビトーブ財団、カナダイノベーション財団、ゲノムカナダ、シックキッズ遺伝学触媒学者。
研究チームは、この研究の実現に協力してくれたハートセンターバイオバンク登録に参加しているすべての家族に感謝します。
ソース：
参考雑誌:
ミティナ、A. 他。 (2024) 心筋症ではゲノム全体のエンハンサー関連タンデムリピートが拡張されています。 eバイオ医学。 doi.org/10.1016/j.ebiom.2024.105027。
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#SickKids #の科学者が心筋症の早期発見の基礎を築く
2024-02-28 03:49:00