SARS-CoV-2 オミクロン BA.2.86 を特徴づける研究: 監視中の新しい変異種

に投稿された最近の記事では、 バイオRxiv* サーバーでは、研究者らは、世界保健機関によって監視中の変異体 (VUM) に指定されている、新たに出現した重症急性呼吸器症候群コロナウイルス 2 (SARS-CoV-2) 塩酸変異体である BA.2.86 の抗原性と感染性の実験的評価を実施しました。 (WHO) 2023 年 8 月 18 日。

研究: SARS-CoV-2 BA.2.86 の抗原性と感染性の特性評価。 画像クレジット: JBArt / Shutterstock

*重要なお知らせ： バイオRxiv は、査読されていない予備的な科学報告書を発行しているため、決定的なものとみなされたり、臨床実践や健康関連の行動をガイドしたり、確立された情報として扱われたりするべきではありません。

背景

これまでのところ、研究者らはBA.2.86のゲノム配列を24個だけ検出している。 ただし、注目すべきことに、それらは渡航歴のない複数の国に住む個人から発生したものです。 BA.2.86 配列は疫学的関連性がない可能性がありますが、この変異体は世界的な蔓延の可能性を示しています。 さらに、BA.2.86 は、その前任者である BA.2 および XBB.1.5 よりも多くの突然変異を抱えており、その明確な抗原性が示唆されています。

耐性の強化を媒介する突然変異 回復期血漿 XBB ブレークスルー感染 (BTI) および再感染による感染は、そのスパイク (S) 糖タンパク質の受容体結合ドメイン (RBD) 内に巣立っています。 さらに、BA.2.86 の N 末端ドメイン (NTD) とサブドメイン 1 (SD1) の変異が耐性の強化に寄与しています。

BA.2.86は、その感染力と引き換えに、進化の過程でより高い免疫回避能力を獲得したようであり、そのためには綿密な監視が必要である。

研究について

本研究では、研究者らはまず BA.2.86 シュードウイルスを開発し、次に野生型 (WT) およびその他の先行する SARS-CoV-2 変異体 (Omicron 亜系統、BA.5、BQ.1.1、XBB など) との抗原距離を決定しました。

さらに、彼らは BA.2.86 シュードウイルスの免疫回避能力を評価しました。 この目的を達成するために、彼らは 2 つのグループからの血漿サンプルを使用し、モノクローナル抗体 (mAb) パネルに対して偽ウイルス中和アッセイを実行しました。

最初のグループはワクチン接種後にXBB BTIを1回だけ経験した27人で構成され、第2グループはBA.5/BF.7によるBTI後にXBB（再）感染症に罹患した回復期患者54人で構成された。 参加者全員は、XBB BTI 前に不活化コロナウイルス感染症 2019 (COVID-19) ワクチンを 3 回接種していました。

さらに、研究チームは、BA.2.86 の主要な RBD 変異を XBB.1.5 で見つかったものと区別し、その変異についてパネルをテストしました。 中和抗体 (nAbs) 1 つの BA.2.86 RBD 変異を保有する XBB.1.5 ベースのシュードウイルスに対するもの。 最後に、チームはBA.2.86の細胞感染力をテストによって評価しました。 の効能 hACE2-HEK293T 細胞株に感染するとそのシュードウイルスが形成されます。

結果

BA.2.86 は、WT、BA.2/BA.5、および XBB.1.5 SARS-CoV-2 変異体からの顕著な抗原ドリフトを示し、XBB 誘発抗体を強力に回避できる可能性があることを示唆しています。 また、すべてのワクチン接種グループにわたって、中和アッセイにおいて非常に高い耐性を示しました。

興味深いことに、BA.2.86 の免疫回避能力は EG.5 を上回りましたが、L455F と F456L の組み合わせ変異を持つ二重変異体である Omicron の「FLip」変異体 HK.3 に匹敵しました。 HK.3 と BA.2.86 の免疫回避レベルは同等であるにもかかわらず、HK.3 と BA.2.86 の相対活性はサンプル間で異なり、抗原性の距離が示されています。 さらに、BA.2.86 は、XBB 刺激血漿に対して著しく高い抗体回避を誘導しました。 SA55 ​​を除いて、この研究でテストされた他の mAb は BA.2.86 を中和できませんでした。

重要なことに、XBB.1.5 変異と組み合わせた E554K 変異は BA.2.86 の血漿回避を強化し、SD1 標的化 nAb が主に XBB 刺激された回復期血漿を構成していることを示唆しています。 さらに、BA.2.86 の NTD 変異により、無力化回避が強化されました。

シュードウイルスアッセイでは、XBB.1.5 および EG.5.1/EG.5 と比較して、BA.2.86 が最も低い感染力を示しました。 著者らは、K356T、V483del、およびE554K変異が主に感染力の低下に寄与していると指摘した。 具体的には、K356T はアミノ酸部位 N354 に N 結合型グリコシル化モチーフを導入し、V483del はアンジオテンシン変換酵素 2 (ACE2) 結合部位の近くにあり、両方の事象がウイルスの宿主細胞侵入効率に影響を及ぼしました。

研究者らは、偽ウイルスアッセイを通じて BA.2.86 の感染力を測定しました。 したがって、これらの結果は、本物の分離株を使用してさらに検証する必要があります。

結論

研究データは、BA.2.86が現在流行しているSARS-CoV-2オミクロン変異種と比較して、例外的な免疫回避能力を示していることを示唆している。 さらに、BA.2.86は、試験したすべてのOmicron変異体より抗原的に遠く離れており、XBB誘導nAbを回避することができ、すなわち、XBB誘発体液性免疫およびXBB有効mAbに抵抗することができた。

ただし、現時点では、BA.2.86 は感染力が低いため、普及しない可能性があるようです。 ただし、宿主ウイルスの進化と伝達中にさらに変異すると、感染力が高まる可能性があります。 Omicron の XBB 亜変異体と同様に、すぐに主要な SARS-CoV-2 変異体になる可能性を考えると、BA.2.86 の時間の経過に伴う進化をグラフ化するには世界的な協力が必要となるでしょう。

*重要なお知らせ： バイオRxiv は、査読されていない予備的な科学報告書を発行しているため、決定的なものとみなされたり、臨床実践や健康関連の行動をガイドしたり、確立された情報として扱われたりするべきではありません。