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2026-03-25 04:20:00
分子設計用のソフトウェアおよび AI ソリューションの大手開発者である Optibrium は本日、PyMOL 用の新しい QuanSA™ プラグインを発表しました。これは、同社の BioPharmics 3D 分子モデリング プラットフォームの一部であるリガンドベースの結合親和性予測メソッドに直感的なグラフィカル ユーザー インターフェイス (GUI) を提供します。新しいインターフェースにより、化学者は強力な化合物の設計を導く正確な親和性予測へのアクセスが容易になり、リードの最適化における合成とテストの負担が軽減されます。
新しい QuanSA PyMOL プラグインによって提供されるビジュアル出力の例。 m32 は、ほぼ同一の水素結合パターン (赤と青の錐体) を持っているにもかかわらず、構造的に類似した m01 よりも約 50 倍強力です。この違いは、黒い矢印で強調表示された表面パッチによって示される追加の立体的な寄与によって説明されます。画像クレジット: Optibrium Ltd.
QuanSA (定量的表面場解析) は、もともと計算の専門ユーザー向けのコマンド ライン ツールとして開発されましたが、現在は新しい PyMOL プラグインとして幅広い化学コミュニティが利用できるようになりました。プラグインの明確な視覚化により、分子の親和性を促進する重要な相互作用が特定され、ユーザーが分子の効力を最適化できるようにする重要な洞察が得られます。
QuanSA は、生物学的標的に対する潜在的な薬物分子の親和性を予測する、差別化され検証された方法です。その物理的動機に基づいた機械学習アプローチは、分子の認識と結合を支配する要因を明示的にモデル化します。これにより、自由エネルギー摂動 (FEP) などの主要なシミュレーションベースの手法と同等の精度が得られますが、計算コストは数分の 1 で、タンパク質構造も必要ありません。 QuanSA を使用すると、プロジェクトのかなり早い段階で正確な親和性予測を利用できるようになり、これらの予測をより多くの化合物やより広範囲の標的に適用できるようになります。
QuanSA プラグインは、Optibrium の分子ドッキング手法である Surflex-Dock 用の PyMOL インターフェイスの最近の導入に続き、高度な 3D モデリング手法をより利用しやすくするための同社の継続的な取り組みを反映しています。コマンドライン インターフェイスは、専門ユーザーや大規模なスクリーニング アプリケーション向けに引き続き完全にサポートされます。
初期段階の創薬は、結合親和性の正確な予測に依存しています。 QuanSA は、最先端のシミュレーションベースの手法と同等の精度を提供することが証明されていますが、計算コストは数分の 1 で、タンパク質構造が利用できない場合でも実現できます。直感的で視覚的なインターフェイスを通じてこの機能をより広範な科学コミュニティに提供することは重要なステップです。これらの予測がより広範囲に適用できるほど、創薬に与える影響は大きくなります。」
Ann Cleves 氏、Optibrium、バイオ医薬品部門、アプリケーション サイエンス担当副社長
オプティブリアム社最高経営責任者のマシュー・シーガル氏は次のように付け加えました。 「分子がどれだけ強く結合するかだけでなく、なぜ標的に結合するのかを理解することは、リードの最適化において非常に価値があります。新しい PyMOL プラグインを使用することで、チームは QuanSA の実証済みの予測と並行して親和性を促進する主要な相互作用を視覚化できるようになり、より適切で自信を持って設計上の決定を下すための洞察が得られます。その結果、前臨床候補へのより多くの情報に基づいた効率的なパスが得られます。」
BioPharmics ライセンス所有者は、PyMOL 用の QuanSA プラグインを追加費用なしで利用できます。
#Optibrium #はリガンドベースの親和性予測を強化するための #QuanSA #用のグラフィカル #インターフェイスを導入しました