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Galaxy でのスケーラブルでアクセス可能かつ再現可能なリファレンスゲノムのアセンブリと評価

これらの著者は同様に貢献しました: Delphine Larivière、Linelle Abueg、Nadolina Brajukaペンシルバニア州立大学、ユニバーシティパーク、ペンシルバニア州、米国生化学および分子生物学部デルフィーヌ・ラリヴィエール、マリウス・ファン・デン・ベーク、アントン・ネクルテンコ脊椎動物ゲノム研究室、ロックフェラー大学、ニューヨーク州、米国リネレ・アブエグ、ナドリーナ・ブラジュカ、ジェニファー・R・バラッコ、メラニー・クートゥア、オリヴィエ・フェドリゴ、グレンヴィル・マクドナルド・グッダー、キャスリーン・ホーラン、ニヴェシュ・ジェイン、キャシディ・ジョンソン、ブライアン・オトゥール、タチアナ・ティリー、エリック・D・ジャーヴィス、ジュリオ・フォルメンティアルバート・ルートヴィヒ大学フライブルク、コンピュータサイエンス学部、バイオインフォマティクスグループ、フライブルク、ドイツクリストバル・ガヤルド＝アルバ & ビョルン・グルーニングソウル国立大学農業バイオテクノロジー学科および農業生命科学研究所（韓国、ソウル）コ・ビョンジュン＆キム・ヒバルジョンズ・ホプキンス大学、生物学およびコンピューターサイエンス学部、米国メリーランド州ボルチモアアレックス・オストロフスキー & マイケル・C・シャッツ医学生命科学部 (MELIS)、進化生物学研究所、ポンペウ・ファブラ大学 CSIC、バルセロナ、スペインマルク・パルマダ・フローレス & トーマス・マルケス・ボネ米国国立衛生研究所、国立ヒトゲノム研究所、計算統計ゲノミクス部門、ゲノム情報学セクション、ベセスダ、メリーランド州、米国ブランドン・D・ピケット、アラン・リー、アダム・M・フィリッピー南カリフォルニア大学、ロサンゼルス、カリフォルニア州、定量および計算生物学部キオン・ラバニ & マーク・JP・チェイソンCIIMAR/CIMAR、海洋環境研究学際センター、ポルト大学、ポルトガル、ポルトアウグスティヌス・アントゥネスポルト大学理学部生物学科（ポルトガル、ポルト）アウグスティヌス・アントゥネス米国マサチューセッツ州ボストンのダナ・ファーバー癌研究所データサイエンス学部チェン・ハオユー米国マサチューセッツ州ボストン、ハーバード大学医学部生物医療情報学部チェン・ハオユーウェルカム・サンガー研究所、ケンブリッジ、英国ジョアンナ・コリンズロモノーソフ モスクワ州立大学、生物工学および生物情報学部、モスクワ、ロシアアレクサンドラ・デニソワミラノ大学生命科学部、ミラノ、イタリアグイド・ロベルト・ガロBMRI、ワイル・コーネル医科大学、ニューヨーク州ニューヨーク州、米国アリス・マリア・ジャンニeGnome, Inc.（韓国、ソウル）ヒバル・キム生命情報学学際プログラム、ソウル国立大学、ソウル、韓国ヒバル・キム＆チョル・リー言語神経遺伝学研究室、ロックフェラー大学、ニューヨーク州、米国チョル・リーカタルーニャ高等研究所 (ICREA)、バルセロナ、スペイントーマス・マルケス・ボネCNAG、ゲノム制御センター (CRG)、バルセロナ科学技術大学 (BIST)、バルセロナ、スペイントーマス・マルケス・ボネカタルーニャ古生物学研究所ミケル・クルサフォント、バルセロナ自治大学、セルダニョラ・デル・ヴァレス、スペイントーマス・マルケス・ボネキプロス大学生物科学部、ニコシア、キプロスシモナ・セコマンディフィレンツェ大学生物学部、フィレンツェ、イタリアマルチェラ・ソッツォーニTree of Life、ウェルカム サンガー研究所、ケンブリッジ、英国マルセラ・ウリアーノ・シルバ米国テネシー州メンフィス、テネシー大学健康科学センター、遺伝学、ゲノミクスおよび情報学部ロバート・W・ウィリアムズスイス、ローザンヌのローザンヌ大学生態進化学部およびスイス生物情報学研究所ロバート・M・ウォーターハウスDL は、GF、LA、CG-A.、BG、AO、HC、MU-S.、BDP、AR、MvdB、および VGP アセンブリ ワーキング グループのサポートを受けてアセンブリ パイプラインを構築しました。 LA、AD、GRG、AMG、GMG、NJ、CJ、BO、SS、MS、TT は、分析に使用される 1 つまたは複数のアセンブリを生成しました。 BJK、KR、および MJPC はキンカチョウのアセンブリを検証しました。 JC はキンカチョウのアセンブリを手動でキュレーションしました。…