重度の急性呼吸症候群コロナウイルス2（SARS-COV-2）は、人類の歴史において前例のないパンデミックを引き起こしました。現在までに、Covid-19に650万人以上の命が失われています（Coronavirus Disease 2019）。ブラジルでのCovid-19ワクチン接種のための広範な努力に続いて、大量ワクチン接種のキャンペーンの後、ブラジルのボツカツ都市で特に顕著であったCovid-19の死亡が劇的に減少しました。私たちの目的は、自治体での大規模な予防接種キャンペーンの前の4週間で、SARS-COV-2の懸念バリアント（VOC）の時間的および疫学的広がりを評価することでした。 400のサンプルをランダム化した後、次世代シーケンスを使用してシーケンスを生成し、バリアントを決定しました。高品質のシーケンスの中で、98.4％がVOCガンマに属し、p.1とp.1.14が最も一般的な系統でした。 p.1は、男性と女性の両方で、およびp.1.14と比較して若い個人と大人（0〜59年）でより頻繁に発生しました。バリアントと併存疾患の存在とそれらの間に、またはそれらの間に相関関係はありませんでした。しかし、P.1は、軽度の疾患のある人や症状を示した人ではp.1.14よりも頻繁でした。系統解析では、ORF1A：M584VおよびA3620Vに変異を含む9 p.1.14サンプルの小さなクラスターが観察されましたが、これはこれまでのガンマシーケンスでは見つかりませんでした。 SARS-COV-2のゲノム監視の重要性は、公衆衛生の意思決定とCovid-19およびその他の疾患の管理を支援することで明らかです。
キーワード：
Covid-19ワクチン接種;ゲノム変異追跡;ゲノム監視; SARS-COV-2バリアント;ワクチン接種の影響。
#ブラジルのボツカツでのマサチューセッツ前ワクチン接種期間中のSARSCOV2バリアントのゲノムおよび疫学的サーベイランス