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2024-08-22 20:21:04
HLA:ペプチド抽出およびサンプル準備ワークフローの最適化。クレジット: 分子および細胞プロテオミクス (2024年)。DOI: 10.1016/j.mcpro.2024.100825
免疫系によって認識される癌細胞の特徴とは何でしょうか? 免疫細胞の潜在的な標的構造に関する知識は、個別化された癌免疫療法の開発の基本的な前提条件です。
ドイツがん研究センター(DKFZ)とNCTハイデルベルクの科学者は、腫瘍特有の「ネオエピトープ」を特定するために、質量分析に基づく高感度の手法を開発した。この分析手法は、このような低濃度のエピトープを検出するように設計されている。 タンパク質 断片化され、最小限の量のサンプル材料しか必要としません。
調査結果は 出版された ジャーナルで 分子および細胞プロテオミクス。
パーソナライズされた免疫療法は、がんとより効果的に闘うための有望なアプローチと考えられています。パーソナライズされた免疫療法には、治療用がんワクチンや、個々の腫瘍に合わせて受容体を調整した T 細胞による細胞療法が含まれます。すべてのパーソナライズされた免疫療法の開発には、患者の免疫システムががん細胞を認識する、がん特有の変化したタンパク質特性を知ることが基本的な前提条件です。
研究者は、免疫系によって認識されるタンパク質の変異断片を「ネオエピトープ」と呼んでいます。これを検出するには、まず腫瘍ゲノムの配列を決定する必要があります。強力なバイオインフォマティクスを使用すると、DNA および RNA の配列決定データを使用して、タンパク質の変化につながる変異を検出できます。したがって、理論的には患者の免疫系によって「異物」として認識される可能性があります。
しかし、免疫系を活性化するには、まず変化したタンパク質の断片が腫瘍細胞の表面に提示されなければなりません。
「がん細胞の膜上にあるいわゆるHLAタンパク質によって提示されるネオエピトープだけがT細胞を活性化できる」とDKFZの免疫学者アンジェリカ・リーマー氏は説明する。
このようなネオエピトープを検出および識別するには、質量分析法 (MS) が使用されます。この分析方法は、電荷を帯びたタンパク質断片の質量の測定に基づいています。
「MS は、ネオエピトープが実際に存在する唯一の真の証拠を提供します。しかし、標準的な MS 方法では、腫瘍ネオエピトープなどの存在量の少ないペプチドは失われ、検出されないことがよくあります」と研究者は説明します。
DKFZとNCTハイデルベルクのリーマー氏とその同僚らは、今後患者の個々の癌新エピトープをより迅速かつ正確に判定するための分析方法を発表した。
研究者らは、腫瘍の DNA と RNA の配列を使用して、まず問題となるタンパク質断片を絞り込みました。HLA 分子の結合特性に関する正確な知識は、腫瘍表面にどのネオエピトープが存在する可能性が最も高いかを予測するのにも役立ちます。
ここで、ちょっとしたコツがあります。まず、これらのペプチドを研究室で合成し、各ペプチドの質量分析計の分析設定を最適化するために使用します。その後、実際の腫瘍組織サンプルを測定します。研究者たちは、ネオエピトープを最もよく検出できるデバイス設定を正確に把握しています。
「その結果、新しいプロトコルでは、はるかに小さな腫瘍組織サンプルで測定が可能になりました」とリーマー氏は説明する。同氏のチームは、わずか 250 万個の癌細胞のサンプルでネオエピトープを検出することに成功した。「それは砂粒ほどの量にも満たない量です」と免疫学者は説明する。
研究チームは、3人の患者から採取した小さな腫瘍組織サンプルで合計5つのネオエピトープを検出することができ、場合によっては患者のT細胞の反応を通じて免疫学的に確認することもできた。
「パーソナライズ がん免疫療法 「今後、ますます重要な役割を果たすことになるでしょう」と、上級著者のリーマー氏は言います。「この文脈において、MS は、がん細胞の表面にネオエピトープが存在するという究極の証拠を提供し、したがって、価値のある治療ターゲットとなります。私たちの optiPRM プロトコルは、最小限の組織サンプルからこの証拠を提供し、個別化されたがん治療のために臨床医に検証済みの腫瘍エピトープを提案するのに役立ちます。」
mRNAベースの 腫瘍 現在進行中のワクチン 臨床試験 多くの場合、約 30 種類の予測される癌のネオエピトープが含まれています。Riemer 氏は、「検証済みのネオエピトープを使用した標的アプローチにより、大幅に少ないエピトープで同じ効果が得られると考えています」と結論付けています。
さらに重要なのは、特定の受容体を備え、特異的に攻撃する治療用T細胞の開発のための標的エピトープの検証であると専門家は強調する。 癌細胞。
詳細情報:
Mogjiborahman Salek 他、optiPRM: 限られた入力材料から変異由来の腫瘍新エピトープを検出する超高感度の標的免疫ペプチドミクス LC-MS ワークフロー、 分子および細胞プロテオミクス (2024年)。 論文番号: 10.1016/j.mcpro.2024.100825
提供元
ドイツ癌研究センター
引用: 新たな研究により、パーソナライズされたがん免疫療法のターゲットが検証される (2024 年 8 月 22 日) 2024 年 8 月 22 日に https://medicalxpress.com/news/2024-08-validates-personalized-cancer-immunotherapy.html から取得
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#新たな研究により個別化癌免疫療法のターゲットが検証される