緑膿菌の進化と宿主特異的適応

（あ) Fortunaによって定義されたDskA1レギュロン内の正に制御された遺伝子（赤）と負に制御された遺伝子（緑）のCF比率によるlog2倍の発現変化のボルケーノプロット視覚化 他. （44) 241の臨床分離株の流行性クローンから大量のRNA-seqデータを解析した（24）が当社の株コレクションに含まれています。B) DksA1は生存を促進する 緑膿菌 CFマクロファージ内に存在する。 緑膿菌細胞関連CFUの計数によって定量化された、分化したWTおよび同質遺伝子F508delホモ接合ノックイン（CF-F508del）THP1細胞にWT（青）、同質遺伝子DskA1-DskA2ダブルノックアウト（ΔDksA1,2;ピンク）、およびDksA1で補完されたノックアウト（（ΔDksA1,2::DksA1;黄色）を感染させてから1時間後と4時間後に測定された。 緑膿菌 PAO1。データ（平均±SEM）は、少なくとも3回繰り返して実行された少なくとも3つの独立した実験の代表値です。***ポ t検定）。Ｃ）上：GFP標識蛍光タンパク質の注入部位を示すゼブラフィッシュの漫画 緑膿菌下: 感染後 1 日目のゼブラフィッシュ幼生全体の代表的な蛍光および微分干渉コントラスト (DIC) 画像。スケール バーは 150 μm。標識された卵黄嚢は自己蛍光を発します。 [Figure created with BioRender.com] （だ) 対照群（上）と対照群（下）の生存分析 cftr モルファント（cftr MO; 下）ゼブラフィッシュの幼生に静脈内（250～350 CFU）で感染させた 緑膿菌 PAO1 WT（青）、ΔDksA1,2ノックアウト（ピンク）、ΔDksA1,2::DksA1補完（黄）蛍光株を6日間生存した動物の割合としてプロットした。データは2つの独立した実験の平均であり、 ん = 各条件につき30～38匹の魚（***ポ E) 実行可能 緑膿菌 感染後1日目のゼブラフィッシュの幼生において 緑膿菌 PAO1 WT（青）、ΔDksA1,2ノックアウト（ピンク）、およびΔDksA1,2::DksA1補完（黄色）蛍光株を、少なくとも3回の独立した実験の魚あたりの平均±IQR CFUとしてプロットし、 ん = 1条件あたり15～20匹の幼虫（***ポ Fと グ) 制御と cftr mCherry標識マクロファージを有するモルファントゼブラフィッシュ幼生 [Tg(mpeg1:mcherry-F)ump2 (45)] 250～350個のGFP標識細胞を筋肉内に感染させた。 緑膿菌 PAO1 WT、ΔDksA1,2、またはΔDksA1,2::DksA1株で、感染はリアルタイム生体内共焦点顕微鏡を使用して追跡されました。(F) マクロファージ(赤)と細胞外(灰色)と細胞内(緑)の自動分類を示す共焦点画像の代表的な3次元再構成 緑膿菌スケールバー、10μm。（G）注入部位の感染マクロファージ数の定量化（左）と、感染後6時間で各マクロファージ内で観察された細菌関連蛍光の量から計算された細胞内細菌負荷のレベル。 緑膿菌 PAO1 WT（青）、ΔDksA1,2ノックアウト（ピンク）、ΔDksA1,2::DksA1補完（黄）蛍光株。データは、条件ごとに少なくとも54個の細胞の平均±IQRとして示されています。 いいえ = 2回の独立した実験から4～6匹の幼虫が記録されました（**ポ ポ