コロラド州デンバー — に関連する病原体を検出する検査 髄膜炎、 脳炎、およびその他の神経学的感染症は従来の診断よりも感度が高く、臨床における診断能力を大幅に向上させる可能性があることが、現実世界の分析結果で示されています。
脳脊髄液 (CSF) からの RNA と DNA のメタゲノム次世代シーケンス (mNGS) は、広範囲の感染因子を同時に検査し、ウイルス、細菌、真菌、寄生虫などの個々の病原体を特定します。
中枢神経系（CNS）感染症が疑われる患者の約半数は、まれな病原体を検出するツールが不足しているため、診断されない可能性があります。 現在、mNGS は専門の検査機関でのみ利用可能ですが、診断へのアクセスを拡大することでこの問題に対処できる可能性があると研究者らは指摘しています。
「我々の結果は、中枢神経系感染症の可能性がある入院患者の定期的な診断精密検査の一環としてCSF mNGS検査を組み込むことを正当化するものである」と臨床検査医学科の教授であるチャールズ・チウ医師、博士は述べた。カリフォルニア大学サンフランシスコ校（UCSF）医学部感染症学科兼臨床微生物研究所所長は記者会見で述べた。
この研究結果は、4月16日に米国神経学会（AAN）2024年年次総会で発表された。
「現実世界」のパフォーマンス
CSF、画像、患者歴、症状に基づいてCNS感染症を正確に診断することは困難である、と研究者らは指摘した。
「中枢神経系感染症と推定される患者の約50％は、実際には診断を受けずに終わっている」とChiu氏は述べた。
これは、希少な病原体に対する診断検査が不足していることと、癌、自己抗体症候群、 血管炎 感染症を模倣する可能性がある、と彼は付け加えた。
CSFは「非常に制限的」であるとChiu氏は指摘した。 「量の観点からも、コストや所要時間の観点からも、考えられるすべての微生物に対して、考えられるすべての検査を実施することは実際には不可能です。」
髄膜炎や脳炎などの感染症の原因を迅速に特定できないと、適切な治療が遅れる可能性があります。
mNGS の「現実世界」のパフォーマンスを評価するために、研究者らは 2016 年から 2023 年にかけて米国およびその他の地域で主に入院患者から 4,828 個のサンプルを収集しました。
全体として、この検査では 16.6% の症例で少なくとも 1 つの病原体が検出されました。 70% 以上が DNA または RNA ウイルスで、次に細菌、真菌、寄生虫が続きました。
高感度
この技術はまた、新規または新興の神経向性病原体を検出することもできました。 黄熱病 輸血感染性脳炎の発生の原因となるウイルスと フザリウム・ソラニ、真菌性髄膜炎の発生を引き起こしました。
研究者らはまた、CSF nMGS検査の成績を一般的に使用されている院内診断検査と比較するために、UCSFの1052人の患者のサブセットに対してカルテレビューを実施した。
「単一の検査として、脊髄液 mNGS の全体的な感度は 63%、特異度は 99%、精度は 90% であることが示されました」と Chiu 氏は述べています。
mNGS の感度は、CSF からの直接検出検査と比較して有意に高かった (46%)。 血液などのCSF以外のサンプルに対して行われる直接検出検査（15％）。 抗体を探す間接的な血清学的検査 (29%) (P すべてで < .001)。
これは、mNGS が「臨床的に区別できない感染症を引き起こす何百もの異なる病原体を検出できる」可能性があることを示唆している、と Chui 氏は述べた。
現在、mNGS 検査は大規模な専門研究所または参考研究所に限定されています。 この検査へのアクセスを増やすには、日常的な臨床検査室や病院の検査室でそれを導入する必要があるとチウ氏は述べた。
「この技術を治療現場、つまり検査を行っている病院の研究室に直接導入できれば、患者により迅速に影響を与える結果を生み出すことができる」と同氏は語った。
ガイディングセラピー
最終的には、診断検査の目的は「治療の指針となる可能性がある実用的な情報を生成すること」だと同氏は付け加えた。
研究者らは現在、同じサブコホートの患者のカルテを評価して、検査が臨床的な違いをもたらしたかどうかを判断している。
「私たちは、それが患者の管理と治療に臨床的な影響を与えたのか、それとも悪影響を及ぼしたのか、それとも臨床的な影響を与えなかったのかを知りたいのです」とChiu氏は述べた。 「このようなデータを生成することは、将来、診断パラダイムの一部としてこの検査の役割を定義するのに役立ちます。」
研究者らは費用対効果の分析にも取り組んでおり、チウ氏は「償還の青写真を確立するには」米国食品医薬品局の検査の承認が必要だと述べた。
の調査結果についてコメントする メドスケープ医療ニュースニューヨーク州アイカーン医科大学神経科教授兼臨床研究副部長のジェシカ・ロビンソン・パップ医学博士は、この技術は特に中枢神経系感染率の高い発展途上国で役立つ可能性があると述べた。
「これが本当に興味深いのは、1 mL などの非常に少量の CSF サンプルを採取して、DNA ウイルスと RNA ウイルスの両方、寄生虫、細菌、真菌など、あらゆる種類の病原体を公平な方法でスクリーニングできることです。そこに病原体があるのか、それとも病原体が存在しないのかを考えてください」と彼女は言いました。。
しかし、この繊細な技術が汚染物質を拾う可能性がある、と彼女は付け加えた。 「たとえば、皮膚や加工に使用される水の中に環境中の細菌がわずかに存在する場合、それを読み取ることができます。」
この研究は、Delve Bio と Chan-Zuckerberg Biohub の支援を受けました。
Chiu 氏は、バイオームの科学諮問委員会またはデータ安全性監視委員会の委員を務めることで個人報酬を受け取り、Delve Bio、Poppy Health、Mammoth Biosciences、および BiomeSense の株式を保有し、ヘルスケア関連の発見または技術から知的財産権を取得しています。 ロビンソン・パップには関連する利益相反はありません。