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高度なモデルはヌクレオソームの位置から遺伝子構造を予測します

クレジット： 核酸研究 （2024年）。 DOI: 10.1093/nar/gkae689 DNA (すべての生物の遺伝情報を運ぶ分子) は、効率的に機能できるように複雑な方法で細胞内にパッケージされています。ヌクレオソームは DNA の圧縮を促進し、遺伝子発現やその他の生物学的プロセスの制御にも重要な役割を果たします。 バルセロナ IRB のモデスト・オロスコ博士率いる科学者チームは、ヌクレオソームの位置を通じて遺伝子構造を予測する高度な計算技術を開発しました。この方法は、実験的アプローチと機械学習技術および信号伝送理論を組み合わせたものです。研究は雑誌に掲載されました 核酸研究。 実験手法に匹敵する予測モデル 過去数年にわたって、科学者たちは MNase-seq などの実験技術を使用してヌクレオソームのマッピングを行ってきました。オロスコ博士のチームが開発したモデルは、DNA 配列情報と物理的特徴を使用して実験データを再現するだけでなく、ヌクレオソームの位置をより迅速かつ正確に予測します。 「私たちのモデルの精度は、最先端の実験手法の精度に匹敵します」と、IRB Barcelona の分子モデリングおよびバイオインフォマティクス研究室の責任者であり、バルセロナ大学の正教授であるオロスコ博士は述べています。 遺伝子制御と生物医学への影響 この研究は、ヌクレオソームの構造が、DNA 配列と遺伝子の末端から発せられる物理的シグナルによって大きく影響されることを示しています。これらのシグナルは、最初と最後のヌクレオソーム (+1 と -last) の位置を決定し、遺伝子に沿ったヌクレオソームの位置にも影響を与えます。 「私たちの研究は、ヌクレオソーム構造が私たちが考えていたよりも複雑な形で遺伝子発現に影響を与える可能性があることを示唆しています」とアルバ・サラ博士は付け加えた。 IRBバルセロナの学生であり、研究の筆頭著者。 このアプローチは、クロマチン構造の変化が疾患の発症にどのような影響を与えるかについての将来の研究にとって鍵となります。 DNA とヌクレオソームの構成をより深く理解することで、科学者は新しい治療標的を特定し、より効果的な治療法を開発できます。 詳細情報: Alba Sala et…