健康

計算ツールは、治療抵抗を促進する可能性のある隠れた癌DNAの変化を暴露します

クレジット：Unsplash/CC0パブリックドメイン 癌における最も有害な遺伝的変化のいくつかも見るのが最も難しいです。腫瘍のDNAの奥深くにあるこれらの構造変化は、特に組織サンプルが小さいまたは劣化している場合、攻撃的な成長を促進し、標準テストを回避することができます。 この課題に対処するために、メイヨークリニックの研究者は、これらのとらえどころのないゲノムパターンに光を当てるBACDACと呼ばれる新しい計算ツールを開発しました。このツールは、研究者が、読み取るDNAシーケンスを使用してゲノム不安定性の兆候を特定するのに役立ちます。 ゲノム全体、低純度または低カバーのサンプルでも。 このツールは、臨床医が腫瘍がどのように行動するかをよりよく予測し、よりパーソナライズされた治療の選択をよりよく予測するのに役立ちます。 染色体の変化の検出 BACDACのアプローチの中核は、細胞内の染色体の完全なセットの数を指す倍数性の概念です。通常のヒト細胞には2つのセット（合計46染色体）がありますが、 癌細胞 多くの場合、大規模な利益または損失を示し、このバランスを混乱させ、未確認の成長を可能にします。 研究で 公開 で ゲノム生物学、研究チームはBACDACを使用して、12のがんタイプの650を超える腫瘍を分析しました。このツールは、研究者が全ゲノムダブルの兆候を検出するのを助けました。ここでは、腫瘍がそのすべてのDNAを複製します。このタイプの異常な倍数性は、しばしばリンクされています 攻撃的な行動 および治療抵抗。 「このツールは、これまで目に見えないゲノムの層を見ることができます」と、Mayo ClinicのBiomarker Discoveryプログラムの研究の主執筆者であり共同ディレクターであるGeorge Vasmatzis博士は言います。 「私たちは数十年にわたってゲノム不安定性の生物学を研究してきました。その知識を大規模に機能するツールに変換することができたのはこれが初めてです。」 BACDACは、腫瘍のゲノム景観の視覚的な要約も提供します。 Constellation Plotと呼ばれるカスタム出力は、腫瘍の染色体が安定しているのか混乱しているのかについての直感的なビューを提供します。これは、研究者と病理学者が結果をより簡単に解釈するのに役立つかもしれません。 次に、メイヨークリニックチームは、BACDACをさらに検証し、臨床的に展開可能な診断ツールに開発する予定です。腫瘍の構造的変化のより明確な見解を提供することにより、治療の決定を通知するのに役立つかもしれません。 詳細： Sarah H. Johnson et al、星座プロットを使用した低パス全ゲノムシーケンスおよび対立遺伝子コピー数の視覚化における腫瘍倍数性測定、 ゲノム生物学 （2025）。 2：10.1186/s13059-025-03599-2 2025トリビューンコンテンツエージェンシー、LLC。 引用：計算ツールは、2025年6月21日にhttps://medicalxpress.com/news/2025-06-06-tool-Exposes-hidden-cancer-dna.htmlから取得した治療耐性を促進する可能性のある隠れた癌DNAの変化を暴露します（2025年6月21日） このドキュメントは著作権の対象となります。私的な研究や研究の目的のための公正な取引とは別に、書面による許可なしに再現される部分はありません。コンテンツは情報のみで提供されます。 #計算ツールは治療抵抗を促進する可能性のある隠れた癌DNAの変化を暴露します