腫瘍内の好中球の決定的な再プログラミング

投稿履歴

受け取った: 2022年11月9日

承認されました: 2023年11月27日

印刷物で出版: 2024 年 1 月 12 日

謝辞

原稿に関する有益な議論とフィードバックを提供してくれた LGN 研究室のメンバー全員、分類とフローサイトメトリーの支援を提供してくれた SIgN フローサイトメトリー チーム、ATACseq および scRNAseq ライブラリーの生成と実行を支援してくれた SIgN Immunogenomics チーム、そして SIgN技術的なヘルプとサポートのためのマウスのコア機能。

資金提供: この研究は、シンガポール免疫学ネットワーク (SIgN) のコアファンディングとシンガポールの A*STAR から資金提供を受けました。 LGN は、中国国家自然科学財団 (助成金 32270956) および上海科学技術委員会 (助成金 20JC1410100) によって支援されています。 MSF は A*STAR キャリア開発基金 (助成金 202D8150) によって支援されています。 IWK は、A*STAR キャリア開発基金 (助成金 202D8197) によって支援されています。 SZC は、A*STAR Career Development Award (192D8043) と SIgN からのコア資金によって支援されています。 YT と HLT は、シンガポール国立医学研究評議会からの Clinician Scientist Awards (NMRC/CSA-INV/0023/2017 および CSAINV20nov-0003) によって支援されています。 SIgN フローサイトメトリー施設は、共有インフラストラクチャ サポート (SIS) (NRF2017_SISFP09) のもと、国立研究財団 (NRF) シンガポールによってサポートされています。 Ultramicroscope II の使用については、A*STAR コア資金、HMBS IAF-PP 助成金 (H1701a0004)、およびシンガポール全土の顕微鏡インフラストラクチャ ネットワークである SingaScope に対する国立研究財団の共有インフラストラクチャ支援助成金 (NRF2017_SISFP10) に感謝いたします。 )、A*STAR 顕微鏡プラットフォームの継続的なサポートのために。 DC-W。 は、CRI アービントン博士研究員制度 (CRI3511) によってサポートされています。 GFC は、スペインの MCIN/AEI/10.13039/501100011033 が資金提供する助成金 PID2022-142341OB-I00 によってサポートされています。 IB は、MICINN の Ramon y Cajal フェローシップ (RYC2021-033511-I) と BBVA Foundation の Leonardo フェローシップ (LEO22-2-2596) によって支援されています。 AV および YZ は、VA に対する NMRC OF-IRG 助成金 (OFIRG19nov-0112) によってサポートされています。 MI は、欧州研究評議会 (ERC) Consolidator Grant 725038、ERC Proof of Concept Grants 957502 および 101138728、Italian Association for Cancer Research (AIRC) Grants 19891 および 22737、イタリア大学研究補助金 PE00000007 (INF-ACT) によって支援されています。および PRIN (2022FMESXL)、および Asher Biotherapeutics および VIR Biotechnology からの資金提供研究契約による。 AH は、NIH/NIAD の助成金 R01AI165661、MCIN の RTI2018-095497-B-I00、ラ・カイシャ財団の HR17_00527、Leducq Foundation の Transatlantic Network of Excellence (TNE-18CVD04)、および FET-OPEN (助成金 861878) によってサポートされています。欧州委員会から。 CNIC は MCIN と Pro CNIC Foundation によってサポートされており、Severo Ochoa Center of Excellence (CEX2020-001041-S) です。 FG は、科学技術研究庁 (A*STAR)、シンガポール NRF 上級調査員シップ (NRFI2017-02)、ギュスターヴ・ルシー財団、および ARC 財団からのシンガポール免疫学 UIBR 賞によって支援されています。

著者の寄稿: 概念化: LGN、MSF、LT、IWK、AH、FG。 正式な分析: KBD、VN、JMC、MWL、LXJ、BYS、GFC; 資金調達: LGN、MSF、IWK、YHL。 調査：MSF、LT、IWK、YR、CMS、KL、YNZ、JJ、KHL、DHL、YCT、DC-W、KY、CB、CN。 方法論：MSF、LT、IWK、YR、CMS、ケンタッキー州DC-W。 プロジェクト管理: LGN; 監修：LGN 視覚化: MSF、LT、IWK、YT、CMS、KL、DC-W、ケンタッキー; 執筆 – 原案: LGN、MSF、LT、IWK、AH、FG、DC-W。 執筆 – レビューおよび編集: すべての著者

競合する利益： MSF、LT、FG、およびLGNは、A*STARによって提出された、癌における免疫抑制性好中球の特徴付け方法を対象とする特許WO2022132041の発明者である。 MI は諮問委員会に参加し、Gilead Sciences、Third Rock Ventures、Antios Therapeutics、Asher Biotherapeutics、GentiBio、Clexio Biosciences、Sibilla Biotech、BlueJay Therapeutics、および Aligos Therapeutics のコンサルティングを行っています。 HLT は、RNAscence Pte. Ltd. の共同創設者および医療顧問です。 Ltd. FG は、iTheos および Genoskin の諮問委員会に参加しています。 残りの著者は競合する利益を宣言していません。

データと資料の入手可能性: 論文の結論を評価するために必要なすべてのデータは、論文および/または補足資料に記載されています。 scRNAseq (GSE243466)、ATACseq (GSE244531)、および空間トランスクリプトミクス データ (GSE244534) は、NCBI Gene Expression Omnibus に寄託されています。 アクセスを容易にするために、3 つのデータセットはすべて 1 つの SuperSeries GSE244536 にリンクされています。