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著者の所属: Wildlife Health Laboratory、ソウル、韓国 (AY Cho、Y.-R. Seo、D.-Y. Lee、D.-H. Lee)。 鳥病研究所、ソウル (AY Cho、Y.-R. Seo、C.-S. Song); 国立野生動物疾病管理研究所、韓国光州(光州)(Y.-J. Si、D.-J. Kim、D. Kim、D. Lee、Y. Son、H. Jeong)。 建国大学人獣共通感染症研究センター、ソウル (C.-S. Song、D.-H. Lee)
高病原性鳥インフルエンザウイルス(HPAIV)による感染症は、養鶏業界に多大な経済的損失をもたらし、公衆衛生に深刻な脅威をもたらしています。 H5 HPAIV の A/Goose/Guangdong/1/1996 (gs/GD) 系統は 1996 年に中国で出現し、遺伝的に独立した 10 の血球凝集素 (HA) クレード (0 ~ 9) とサブクレード (1)。 H5 HPAIV の gs/GD 系統は世界中で大流行を引き起こし、さまざまな野生動物、家禽、人間に感染しています (1)。 複数のノイラミニダーゼ (NA) サブタイプを含むクレード 2.3.4.4 H5Nx HPAIV (2) は 2014 年以降世界中で発生の大半を占めており、さらにサブクレード 2.3.4.4a ~ h (3)。 現在、クレード 2.3.4.4b H5N1 HPAIV は、2020 年秋にヨーロッパ、アフリカ、南北アメリカ、アジア、南極で大流行を引き起こした後、世界的に優勢となっています (4–7)。
2022年10月から2023年3月にかけて、合計16の異なる遺伝子型のH5N1 2.3.4.4b HPAIVが韓国で大流行を引き起こし、その中には野鳥での174件の感染者が含まれていた(8)。 利用可能な監視データに基づくと、2023 年の夏から秋にかけて韓国では新たなウイルスの侵入は発生していません。HPAIV の国家監視は 2023 年の秋に韓国で始まりました。 2023 年 12 月 (A/オオハクチョウ/韓国/23WC075/2023)[H5N6]A/オオハクチョウ/韓国/23WC116/2023[H5N6]と A/ヒガンバナ/韓国/23WC111/2023[H5N6]) (付録 表1)。 私たちは分離株の次世代シーケンスを実施し、完全なゲノム配列を公開しました。 ウイルスの起源と進化を推測するために、比較系統解析を実施しました。
すべての H5N6 分離株は、HA タンパク質分解切断部位 (REKRRKR/GLF) における複数の塩基性アミノ酸の存在に基づいて HPAIV として同定されました。 GISAIDデータベースのBLAST問い合わせ(https://www.gisaid.org)8つの遺伝子すべてが、2023年に日本でハヤブサから同定されたクレード2.3.4.4b H5N6ウイルスと最も高いヌクレオチド配列同一性(99.77%~100%)を共有することを示した(A/ハヤブサ/佐賀/4112A002/2023)[H5N6])、韓国の H5N6 ウイルスと同じゲノム配列を保有しています (テーブル)。 HA 遺伝子は、2022 年から 2023 年にかけて韓国で流行した H5N1 クレード 2.3.4.4b HPAIV の主要遺伝子型 a とクラスター化しました (8)。 H5N6 ウイルスの NA 遺伝子は、2018 年に家禽とヒトで以前に分離された中国由来の H5N6 HPAIV とクラスター化していましたが、他の内部遺伝子は遺伝的に異なっていました。 ポリメラーゼベーシック 1 およびマトリックスタンパク質遺伝子も、韓国の 2022 ~ 2023 年の H5N1 HPAIV とクラスター化しました。 ユーラシアにおける低病原性鳥インフルエンザウイルスにクラスター化されたポリメラーゼ塩基性 2、ポリメラーゼ酸性、核タンパク質、および非構造遺伝子 (付録 図2)。
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形。 韓国の野鳥から回収された新規再集合体高病原性鳥インフルエンザ A(H5N6) クレード 2.3.4.4 b 分離株の最も一般的な祖先の探索。 A) ウイルスの最大クレード信頼性ツリー…
H5N6 ウイルスと A/ハヤブサ/Saga/4112A002/2023(H5N6) の各遺伝子の最新の共通祖先 (tMRCA) までの推定時間は、2023 年 2 月から 11 月までの範囲でした (形; 付録 表2)。 tMRCA の 95% 最高事後密度間隔の重複に基づいて、新規の再集合 H5N6 ウイルスが 2023 年 8 月から 10 月頃に出現し、日本と韓国に持ち込まれたと推定されます。 NA遺伝子の最大クレード信頼性ツリーにより、日本と韓国の野鳥H5N6ウイルスが中国のH5N6ウイルスのヒト感染例(A/長沙/2022年1月)と共通の祖先を共有していることが明らかになった。 2014 年以来、中国では合計 90 人の H5N6 感染者が報告されています。ほとんどの感染は 2021 年以降に報告されています (9; https://iris.who.int/handle/10665/375483)。 日本と韓国の野鳥 H5N6 ウイルスと中国のヒト感染 H5N6 ウイルスの tMRCA は、2022 年 6 月 12 日と推定されます (95% 最高事後密度は 2021 年 12 月 7 日から 2022 年 11 月 10 日) (形; 付録 表2)。 中国で流行している祖先型 H5N6 HPAIV は、2022 年後半にクレード 2.3.4.4b H5N1 ウイルスに NA 遺伝子を提供した可能性があります。 現在および祖先型 H5N6 HPAIV の N6 遺伝子には、家禽におけるウイルスの循環中に獲得された可能性のある茎欠失がありました (10)。
H5N6 ウイルスは、HA に分子マーカー T188、V210、Q222、および G224 を有しており、これらはα-2,3 シアル酸受容体への結合親和性に関連しています。 我々は、α-2,6 シアル酸受容体への結合の増加に関連することが知られている HA の S133A および T156A 変異を観察しました。 ポリメラーゼベーシック 2 では L89V が観察されましたが、Q591K、E627K、および D701N は観察されませんでした。 また、マウスにおける毒性の増加に関連する、ポリメラーゼ塩基性 1 の D622G、ムスカリン性 1 の N30D および I43M、および非構造タンパク質 1 の P42S も観察されました (10)。
これまでの報告では、クレード 2.3.4.4b のゲノムが頻繁なゲノム再集合を通じて進化し、遺伝子セグメントの会合の明らかなパターンがなく、一時的で多様なゲノム配列変化を形成していることが示唆されています (8)。 2023年から2024年の越冬期に韓国と日本の野鳥からH5N6 HPAIVが検出されたことと、我々の系統解析により、H5N6 HPAIVは2022年から2023年に流行したクレード2.3.4.4bのH5N1ウイルスに由来し、他の低次ウイルスとの再集合から進化した可能性が最も高いことが示唆される。病原性は鳥インフルエンザウイルスとHPAIVであり、秋の渡りの季節に野鳥によって韓国と日本に持ち込まれた。 ウイルスのさらなる進化と蔓延を早期に検出し監視するには、野鳥における HPAIV のゲノム監視を強化する必要があります。
チョ氏は建国大学獣医学部の博士課程候補者です。 彼の研究対象には、分子疫学と鳥の病気に対するワクチンの開発が含まれます。
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2024-05-03 22:48:49