著者の所属: カナダ、オンタリオ州、ハミルトンのマクマスター大学 (Z. Fatima、P. Jayaratne、D. Leto、M. Smieja)。セント・ジョーズ・ハミルトン研究所、ハミルトン（Z. ファティマ、A. アラビ、M. スミージャ、MR ハサン）。ハミルトン地域臨床検査医学プログラム、ハミルトン (P. ジャヤラトネ、C. ラザフォード、D. レト、M. スミージャ、MR ハサン)
マイコプラズマ肺炎 これは、特に小児における上気道および下気道感染症の原因であり、風土病および流行パターンで発生します。気管気管支炎は一般的ですが、肺炎が臨床的に最も重大な症状であり、流行期に市中感染する細菌性肺炎の約 4% ～ 8% を占めます (1）。マクロライドは引き続き主な治療法です 肺炎球菌しかし、臨床的に関連する耐性の世界的な上昇により、治療に対する課題が増大しています（2）。新型コロナウイルス感染症のパンデミックに関する制限が 2023 年中に縮小されたため、 肺炎球菌 発生率と流行は世界中で大幅に増加しています（3–5）。カナダのオンタリオ州では、2024 年 5 月以降、遅れながらも前例のない検出率の増加が報告されており、陽性率は最大 30% に達しています (6）。マクロライド耐性率とP1シタアドヘシンの種類を評価しました。 肺炎球菌 2024年から2025年にカナダのオンタリオ州ハミルトンで発生した感染症を調査し、新型コロナウイルス感染症のパンデミック前に収集された株と比較した。
2024 年 1 月から 2025 年 4 月にかけて、3,717 人の患者から合計 4,297 個の鼻咽頭スワブ (NPS) 検体が、ハミルトンのハミルトン地域検査医学プログラムの微生物検査室に届きました。 肺炎球菌 研究室で開発された PCR による検出。全部上映しました 肺炎球菌–PCR ジェノタイピングによるマクロライド耐性の陽性サンプル (重複を除去した後、n = 417) と、P1 シタアドヘシン遺伝子の RepMP4 領域を増幅することによって、各月からランダムに選択された陽性検体の約 25% サブセット (n = 110) に対して P1 シタアドヘシン タイピングを実行しました (7）およびナノポア技術による配列決定（Oxford Nanopore、 https://nanoporetech.com） （付録）。パンデミック後の期間中に受け取った検体に加えて、追加の 肺炎球菌–2013年から2020年の間に受け取った陽性サンプルは、マクロライド耐性（n = 45）とP1タイプ（n = 23）について検査されました。差異の統計的有意性を評価しました。 肺炎球菌 小さいサンプルサイズに合わせて調整するイェーツ補正を備えたχ2 検定を使用した、さまざまな患者グループ間の検出率とマクロライド耐性。 (付録)。
図1
図 1. マクロライドの有病率、耐性率、P1 遺伝子型分布 マイコプラズマ肺炎 2024年から2025年の流行中、カナダのオンタリオ州ハミルトンで。 A) マクロライド感受性およびマクロライド耐性の月間検出率 肺炎球菌…
平均して、患者の 14.2% (381/2,680) が検査で陽性でした。 肺炎球菌 2024年には、2022年の0.34% (2/576)、2023年の0.36% (2/555)と比較して、陽性率は徐々に増加し、2024年5月以降、2024年9月に22.5%のピークに達しました。9月以降、陽性率は着実に低下し、図1のパネルAに達しました。別表2）。 PCR ジェノタイピングでは、マクロライド耐性に関連する一塩基多型 (SNP) が 1 つだけ特定されました。A2063G は、高レベルのマクロライド耐性 (エリスロマイシン MIC > 64 mg/L) を与えることが知られています。この発見は、2011 年から 2012 年にかけてオンタリオ州から分離された株の 90% 以上が同じ変異を持っていたと報告した研究と一致しています (8）。
次にマクロライド耐性率を比較しました。 肺炎球菌 2013～2020年と2024～2025年の株（新型コロナウイルス感染症のパンデミック前とパンデミック後の期間を表す）では、17.8%（パンデミック前）と11.8%（パンデミック後）であった。この差は統計的に有意ではありませんでした (p = 0.24) (図 1、パネル C)。 P1 入力による、89/110 (81%) 肺炎球菌 菌株は P1-1 タイプに属し、21/110 (19.1%) は P1-2 タイプに属しました。 P1-1タイプのマクロライド耐性率 肺炎球菌 P1-2 型株の割合 (7.7%) よりも有意に高かった (p = 0.04) (図 1、パネル D)。 2013 年から 2020 年の間に、78.3% 肺炎球菌 株は P1-1 タイプでしたが、2024 年から 2025 年には 81% でした。 P1-1 タイプと P1-2 タイプの割合は 2 つの期間で有意な差はありませんでした (p = 0.85)。 P1-2タイプのうち 肺炎球菌 2k、2b、および 2g/2j 変異株は、2013 年から 2020 年の間に収集された検体から検出されました。どちらの期間でも 2g/2j バリアント (50%) が優勢でしたが、2c/2k バリアントの割合 (36.4%) は 2024 年から 2025 年にかけて増加しました (図 1、パネル E)。
図2
図 2. 系統解析 マイコプラズマ肺炎2024年から2025年にカナダのオンタリオ州ハミルトンで流行した際のP1シタアドヘシン-RepMP4遺伝子型解析に基づく。根のない木は、田村根モデルによる隣接結合法を使用して構築されました。
私たちの研究は、マクロライド耐性率とP1遺伝子型のスナップショットを提供します。 肺炎球菌 前回の州報告からほぼ 10 年後、カナダのオンタリオ州ハミルトンで株が発見されました。マクロライド耐性率はその期間にわたって安定しているように見えますが、マクロライドの P1 シタアドヘシン タイプに大きな変化が観察されました。 肺炎球菌 ハミルトン地域を循環しています。臨床医や他の公衆衛生専門家は、これらの変化と、それらが引き起こす呼吸器感染症の臨床および公衆衛生管理に対する潜在的な影響を認識しておく必要があります。 肺炎球菌 オンタリオ州で。
ファティマ博士は、セントジョーズ研究所およびマクマスター大学の博士研究員です。彼女の研究は、感染性病原体のゲノム監視に焦点を当てています。ジャヤラトネ博士はマクマスター大学の准教授です。彼の主な研究対象は、感染症の分子診断検査の開発です。
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2025-12-23 21:55:00