インディアナ大学メルビン・アンド・ブレン・サイモン総合がんセンターの研究者らは、これまでで最も広範囲にわたる健康な乳房細胞のマッピングを完了しました。この研究結果は、IU および他大学の研究者らが乳がんの発症の仕組みや遺伝的祖先間の乳房組織の違いを理解するための重要なツールとなります。
今月公開 ネイチャーメディシン研究者らは、多様な祖先を持つ女性の健康な乳房組織を使用して、乳房組織細胞の包括的なアトラスを作成した。このアトラスには、各細胞タイプにおけるゲノムの構成の詳細や、このゲノム構成が各細胞タイプにおけるRNAの生成に及ぼす影響、そして乳房のさまざまな部分でそれらの機能を促進する仕組みなどが含まれている。
乳がんは、遺伝的祖先によって結果が異なります。社会経済的要因が一因であることは確かですが、生物学と祖先も役割を果たしていると私たちは考えています。この研究は、生物学的、祖先的側面に取り組む上で役立つでしょう。」
ハリクリシュナ・ナクシャトリ博士、本研究の主任著者
ナクシャトリ氏は、インディアナ大学医学部のマリアン・J・モリソン乳がん研究教授であり、インディアナ大学サイモン総合がんセンターのヴェラ・ブラッドリー財団乳がん研究センターの研究者です。
ナクシャトリ氏の研究室は、インディアナ大学サイモン総合がんセンターのコメン組織バンクに健康な乳房組織を提供した92人の女性から採取した88,000個の細胞核の配列を解析した。提供者には、アフリカ系、ヨーロッパ系、アメリカ先住民、ヒスパニック系、東アジア系、東南アジア系、アシュケナージ系ユダヤ系ヨーロッパ系の血統を持つ人々が含まれていた。
細胞マッピングには、さまざまな細胞タイプで発現する遺伝子に関するデータだけでなく、遺伝子がどのように構成されているか、また、どの特定の遺伝子発現が各細胞タイプに限定されているかに関するデータも含まれます。研究者は、乳がんはほとんどの場合、特定の細胞タイプで発生し、発生場所によってがんの種類や治療反応が異なることを知っています。この研究は、乳がんの発症に関する理解を深め、新しい治療ターゲットの特定につながる可能性があります。
「この研究は、正常な乳房の構成要素を理解することを目的としました。つまり、正常な乳房にはどのくらい多くの種類の細胞が存在するのか、そしてその細胞の構成要素は遺伝的祖先に依存した変動を示すのかということです」とナクシャトリ氏は言う。「乳房のどの種類の細胞からがんが発生したのかを知らなければ、正常な乳房と比べて乳がんの何が問題なのかを正確に理解することはできません。」
これまで利用可能な研究リソースでは、乳がん手術や乳房縮小術のサンプルから採取した正常組織が使用されていました。世界で唯一の健康な乳房組織バンクであるコメン組織バンクは、IU の研究者にこの研究を行うユニークな機会を提供します。
「私たちは、臨床的に乳がんのない女性の組織を使用しています。そのため、私たちが作成したデータは完璧に近い、まさに可能な限り完璧なものだと信じています」とナクシャトリ氏は語った。「私たちが作成したデータは、将来の研究のために非常に多くのグループによって使用されるため、永久に保存されます。」
この研究から得られた細胞アトラスの情報は、国立衛生研究所、Human Cell Atlas、Chan Zuckerberg CELL by GENE Discover が提供するデータベースを通じて、乳がん研究者に広く公開される予定です。
この研究は、ナクシャトリ研究室の約 5 年間にわたる集中的な研究とバイオインフォマティクス分析の集大成です。その他の IU 医学部および IU サイモン総合がんセンターの著者には、Poornima Bhat-Nakshatri、Hongyu Gao、Aditi S. Khatpe、Adedeji K. Adebayo、Patrick C. McGuire、Cihat Erdogan、Duojiao Chen、Guanglong Jiang、Rana German、Lydia Emmert、George Sandusky、Anna Maria Storniolo、Yunlong Liu が含まれます。
ソース：
ジャーナル参照:
バット・ナクシャトリ、P.、 その他. (2024). 多様な遺伝的祖先を持つ女性の乳房組織の単核クロマチンアクセシビリティとトランスクリプトームマップ。 ネイチャーメディシン。 doi.org/10.1038/s41591-024-03011-9。
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#新しい乳房細胞アトラスが癌の発症における遺伝的祖先の役割を解明
2024-08-13 00:12:00