ニューヨーク – 独立した研究チームは、胃がんと前立腺がんの分子サブタイプ、臨床的特徴、および潜在的な脆弱性を特徴付けるために、リン酸化プロテオームプロファイリングに注目しました。
最初の研究では、 出版された セルレポート 火曜日、日本の国立がん研究センター中央病院、京都大学、および日本の他のセンターのチームが、多重液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析法を用いて、ステージIからステージIVの胃がん患者73人から採取した治療前の胃がん検体127個と正常な隣接組織におけるタンパク質リン酸化パターンを特徴づけた。
研究チームの説明によると、サンプルは内視鏡的生検で採取され、採取後20秒以内に液体窒素で凍結された。さらに、第2選択化学療法の進行前、進行中、進行後に進行胃がん患者9人から連続生検サンプルを採取した。
彼らの分析により、プロテオミクスに基づく胃がんのサブタイプと進行パターンが明らかになった。」[T]「この概念実証研究は、新鮮凍結内視鏡生検標本を用いた癌細胞のリン酸化プロテオーム分析法が、癌のサブタイプを定義できるだけでなく、治療による癌のシグナル伝達の動的な変化を捉えることもできることを実証している」と、京都大学医薬基盤・健康・栄養研究所の研究員である共同主任著者および共同責任著者の安達淳氏と、国立がん研究センター病院および東京大学の研究者である朴成一氏、および彼らの同僚は書いている。
特に研究者らは、酸化リン酸化（OXPHOS）、増殖性、上皮間葉転換（EMT）の特徴を特徴とするサブタイプを追跡した。これらのサブタイプは、未治療の胃がん症例のそれぞれ50％、35％、15％を占めていた。
例えば、EMT が豊富な「サブタイプ 2」では、研究チームは、間葉系マーカーと好中球マーカーの通常より高い発現、および AXL キナーゼと GAS6 リガンドの活性の増強を確認しました。この結果を受けて、胃がん細胞株と異種移植マウス モデルで AXL チロシンキナーゼ阻害剤 (TKI) を含む併用療法の使用に関する一連の実験が行われました。この治療は「間葉系に相加的な抗がん効果をもたらしました」。 [gastric cancer] 「細胞株と異種移植モデル」と研究者らは報告した。
に掲載された論文 PNAS 一方今週、上海第二軍医大学、中国科学院、および中国の他のセンターの研究者らは、タンデム質量分析法を用いて、局所性前立腺がんを患う中国人41名から採取した、ペアの前立腺がんおよび対応する正常サンプルのプロファイルを作成した。この参加者のサブセットは、中国前立腺がんゲノムおよびエピゲノムアトラス（CPGEA）のゲノム配列解析、トランスクリプトーム配列解析、およびDNAメチル化解析を用いて評価された。
「タンパク質の変化、その発現、活動、遺伝情報を精査することで、前立腺がんの発生、進行、民族集団間の差異を引き起こす分子メカニズムを解明することを目指している」と著者らは記している。
研究者らは、10,602 個のタンパク質と、5,800 個を超えるタンパク質の約 21,700 個のリン酸化部位のプロファイルに基づいて、異なる分子的および臨床的特徴を持つ 3 つのプロテオーム癌サブタイプを特定しました。「注目すべきことに、これらのプロテオーム サブタイプは、ホスホプロテオームにおいて同等の異質性を示し、独自の代謝、増殖、および免疫浸潤特性を特徴としています」と研究者らは記しています。
このチームのメンバーは、前立腺がんの無再発生存率を予測するためのタンパク質ベースのバイオマーカーに焦点を当てる取り組みと並行して、SRPK1とSRSF1が前立腺がんS-IIサブタイプに関係していることに基づき、SPHINX31と呼ばれる阻害剤を使用して、セリン/アルギニンに富むスプライシング因子1 (SRSF1) のリン酸化を制御するSRPK1キナーゼを標的にする可能性を検討しました。
著者らは、この研究は「中国人集団における前立腺がんの分子メカニズムを理解するための貴重なリソースを提供し、前立腺がん患者の個別治療戦略の開発を促進し、予後分析を向上させる可能性がある」と示唆した。
#リン酸化プロテオミクス研究により胃がん前立腺がんのサブタイプと治療ターゲットが明らかに