タンパク質データバンクにおけるウォーカー A モチーフを含む β-α-β 超二次構造の統計解析

土井: 10.1007/978-1-0716-4213-9_6。

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所属

• 1 名古屋大学大学院情報学研究科（愛知県名古屋市）
• 2 名古屋大学高等研究院（愛知県名古屋市）
• 3 名古屋大学大学院工学研究科（愛知県名古屋市）
• 4 名古屋大学大学院情報学研究科（愛知県名古屋市） [email protected]。
• 5 名古屋大学グリココア研究所（愛知県名古屋市） [email protected]。

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佐久間公也 ほか方法 Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ． 2025年。

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土井: 10.1007/978-1-0716-4213-9_6。

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抽象的な

最先端のバイオインフォマティクスツールを組み合わせてタンパク質データバンク（PDB）全体を分析するアプローチを紹介します。興味深い事例として、Walker-A モチーフおよびこのモチーフの有無にかかわらず β-α-β 超二次構造の配列/立体構造解析を報告します。統計分析により、Walker-A モチーフは 1 つまたは 2 つのβ鎖が介在する β-α-β ユニットと強く相関しているが、一般に β-α-β ユニットは、β 鎖を介さずに β 鎖間に直接接触を示す傾向があることが明らかになりました。 。

キーワード:

フラストレーション。機能上の制約。 P ループ。タンパク質データバンク;構造生命情報学;ウォーカー – モチーフ。 β-α-β超二次構造。

パブメッドの免責事項

参考文献

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#タンパク質データバンクにおけるウォーカー #モチーフを含む #βαβ #超二次構造の統計解析