健康

アルツハイマー病研究のための検索可能なデータベース

アルツハイマー病の研究に役立つ検索可能なデータベースが準備されました。 オハイオ州立大学ウェクスナー医療センターおよび医学部の神経科学および生物医学情報学の研究者が、包括的でユーザーフレンドリーなリポジトリを作成しました。 ssREADとして知られるこの無料データベースは、オンラインで公開された論文で概説されている。 ネイチャーコミュニケーションズ。 アルツハイマー病は認知症の最も一般的な原因であり、症例の最大80％を占めています。アルツハイマー病協会の2023年アルツハイマー病の事実と数字のレポートによると、現在、65歳以上のアメリカ人のうち推定670万人がアルツハイマー型認知症を患っています。 このデータベースは、アルツハイマー病の病理学の研究に役立ちます。病理学では、病気に関連する原因、発症、構造的/機能的変化、自然史を調べます。 アルツハイマー病の病理の根底にある分子シグネチャーは、単一細胞および単一核 RNA シーケンシング (scRNA-seq および snRNA-seq) と空間トランスクリプトミクスを通じてますます研究されるようになっています。 「これらの技術は、細胞レベルと分子レベルでのアルツハイマー病の発症と性差の探究に新たな光を投げかけています。私たちのssREADリポジトリは、最適化された分析パイプラインと改善された使いやすさを備え、より幅広いアルツハイマー病関連のデータセットを提供します」と、オハイオ州立大学神経科学助教授で本研究の共同責任著者であるホンジュン・「ハリー」・フー博士は述べています。 データセット このデータベースには、67 件のアルツハイマー病関連の scRNA-seq および snRNA-seq 研究から得られた 277 件の統合データセット (合計 7,332,202 個の細胞) が含まれています。リポジトリには、85 件のヒトおよびマウス研究から得られた 381 件の空間トランスクリプトミクス サンプルも含まれています。 細胞タイプや空間レイヤーを含む詳細な注釈 遺伝子発現の差異と機能エンリッチメント解析 空間的に変化する遺伝子と単一細胞データセットによるデコンボリューションインタラクティブな視覚化 包括的な分析解釈とフィルターを提供するユーザーフレンドリーなWebサーバーは、複数の選択をサポートします。 クラスター、セルタイプ、空間レイヤーの散布図 遺伝子発現プロファイルの特徴プロットとバイオリンプロット リアルタイム遺伝子セットエンリッチメント解析「私たちはこの専門データベースを作成することで、研究者のギャップを埋めています。これらの多様なデータセットと病状を統合することは、アルツハイマー病の複雑な状況を研究する研究者にとって非常に貴重なものとなるでしょう」とオハイオ州立大学生物医学情報学部の教授であるチン・マー博士は述べています。…