グラフィック=ジェミナイ。
韓国を含むグローバルNGS(Next Generation Sequencing)ベースのがん遺伝子検査現場で偽陽性(偽検出)を減らすために判定基準を最適化した後も、分析パイプライン(ソフトウェア)設定や判定基準などの条件によって偽陽性エラーが最大14倍発生することが分かった。 NGSベースのがん検査は、何百もの遺伝子を一度に解読して最適化された抗がん剤を探す精密診断技術です。臨床でこの結果が治療選択根拠として活用されるだけに、グローバル臨床現場でNGS感度・特異度基準と品質管理体系を標準化しなければならないという意見が出ている。
31日、国立がんセンター（以下センター）によると、センターがん分子生物学研究科研究チーム（以下、研究チーム）は最近、国内外公認された参照物質（基準サンプル）を活用してNGS検査で偽陰性（偽陰性）と偽陽性を同時に定量評価できるモデルを構築した。
研究チームはこれを通じて検査機関・キット・分析パイプライン（ソフトウェア）の組み合わせによるエラー偏差を比較・点検が可能だったと説明した。現場で通常適用する判定基準（カットオフ）を最適化した後にも偽陽性エラー偏差が約１３～１４倍と集計されたと発表した。
研究チームはこの結果を置いて同じサンプルでも分析ソフトウェア設定と判定基準適用方式によって結果が大きく異なることがあり、装備・キットの交換だけで信頼度問題を解消しにくいと指摘した。これに分析パイプラインと判定基準を同じ尺度で管理・点検する国内外の医療体系が必要だと明らかにした。各機関がソフトウェア感度と特異度を共通基準で測定・最適化しなければならないという説明だ。
例えば、感度を上げれば低頻度変異（がん関連突然変異）をさらに把握することができるが、偽陽性が増えることができ、偽陽性を過度に抑制すれば必要な変異（がん治療標的となる変異）を見逃すことができ、共通基準の準備が緊急であるということだ。
医療界ではNGS標準化前決課題として△基準サンプル（参照物質）ベースの定期評価体系△感度・特異度許容基準設定△レポート基準標準化△判定基準と分析条件 周期的再点検 △結果再現性モニタリング体系の構築などを挙げた。
匿名を要求した医療界専門家は「今回の研究結果の意義は世界各医療機関の限界を数値で確認し、最適化方向の必要性を明確に示したということにある」とし「今は国内を含む医療臨床現場でNGSに「何を使うか」より「どのような基準で管理するか」を強調した。
イム・ジョンクォン記者 [email protected]
#がん遺伝子検査分析方法別エラー最大14倍の差