ProFoldBio チームは、ソフトウェアによってそのような発見方法へのアクセスを拡大することを目指しています。 「この種の計算ワークフローやインフラストラクチャは、通常、大規模なバイオテクノロジー企業のみが利用できます」と分子生物学博士のエリカ・キーン・リベラ氏は言う。学生であり会社のCEO。同チームは、プログラミングではなく実験に強みを持つ研究者がすぐに設計を開始できるように、一般に利用可能なプラットフォームに生成 AI ツールを統合したため、このソフトウェアは中小企業や独立研究者にとって恩恵となる可能性がある。 「私たちのプラットフォームを使用するための参入障壁はかなり低いです」とキーン・リベラ氏は語った。
新しいベンチャープログラムがスタートアップを刺激する
ProFoldBio チームは、UCSB の 8 か月間のニュー ベンチャー プログラムを通じて 2023 年に結成されました。このプログラムでは、あらゆる分野の学部生と大学院生のチームが集まり、教員や業界のメンターの指導を受けながら、ビジネス アイデアを開発し洗練させます。このプログラムは毎年恒例の New Venture Competition (NVC) で最高潮に達し、ファイナリストは最大 40,000 ドルの現金、スタートアップ補助金、サポートを獲得するために競い合います。
アミロイド疾患に対する彼らの共通の関心に触発されました。ロボ、キーン・リベラ、化学工学博士課程学生 デボン・カランとカリフォルニア大学バークレー校の化学工学卒業生であるベンチュラ リベラは、ソフトウェア プラットフォームを開発するために協力しました。
キーン・リベラとロボは、UCSB 神経科学研究のハリマン教授であり、UCSB 神経科学研究所の共同所長であり、神経変性疾患分野の第一人者であるケネス・コシックと協力してきました。
チームは協力して、タンパク質構造ファイルの 3D レンダリングを生成し、標的領域を指定し、設計戦略を構成し、生成 AI を利用して、研究者が研究室で生産および検証する有望な抗体の開発と選択を支援できるプラットフォームを構築しました。技術的な作業に加えて、大学院生はバイオテクノロジーのリーダーにインタビューし、彼らのプラットフォームが埋める可能性のある創薬のギャップについて詳しく学びました。
チームは複数の情報源から評価を受けています。当初は DeNovo Therapeutics と呼ばれていましたが、2024 年の NVC で 2 位と 7,500 ドルの賞金を獲得しました。それ以来、同社はカリフォルニア大学バークレー校 SkyDeck の Pad-13 インキュベーター プログラムに招待されています。 2025 年、同社の疎水性相互作用クロマトグラフィー モデルは、薬物の疎水性を評価するプラットフォームの能力に基づいて、Ginkgo Bioworks 抗体開発コンペティションで 3 位を獲得しました。これは、薬物が製造に適しているかどうか、およびその薬物が効果的に目標に到達できるかどうかを示す尺度です。
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