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リバプール大学の研究では、高度な遺伝的およびゲノム技術を使用して、感染性腸疾患の理解と診断における大きな前進を提供しています。この研究はジャーナルに掲載されています ゲノム医学。
大規模な研究 2つの最先端のツールを利用するために、下痢疾患のある人から1,000を超える便サンプルを分析しました。
感染性腸疾患の一般的な症状である下痢は、英国で毎年推定1800万人に影響を与えています。しかし、その有病率にもかかわらず、伝統的なラボテストは、特に感染症が身元不明または出現した病原体によって引き起こされる場合、その原因を認識できないことがよくあります。
この研究では、メタゲノミック（DNAベース）およびメタトランスクリプトム（遺伝子またはRNAベース）シーケンスを使用しました。従来の方法とは異なり、これらの技術は、研究室で成長する生物に依存していません。代わりに、患者サンプルから遺伝物質を直接検出および分析します。
リバプール大学の共同主演著者であるエドワード・カニンガム・オークス博士、獣医生態科学研究所、「これは、伝統的な診断をこれらの次世代ツールと比較するための英国最大の研究です。標準的なテストで見逃された感染症を見つけただけでなく、標準的な診断が見られないようにすることができます。
この作業は、ヒトの便サンプルから直接サルモネラ遺伝子発現の包括的なスナップショットを初めて捉えています。トランスクリプトームデータは、人間の腸を離れた後、細菌がどのように生き残り、適応するかについての新しい洞察を提供します。
サルモネラは英国の優先下痢病原体であるため、科学者がこの危険な病原体を標的とするのを助けるために知識は非常に貴重です。
特に、RNAとDNAの比率は、無害な腸微生物の真の感染を区別するのに役立ちました。 DNAデータとRNAデータの両方を組み合わせることにより、研究者は感染プロセスの最も明確で最も正確な画像を獲得しました。
大学のゲノム研究センターの共同ディレクターである共同主導の教授Alistair Darbyは、「この研究は、遺伝子ツールが腸感染をどのように識別し理解するかをどのように革命を起こすことができるかを示しています。
この調査結果は、英国およびそれ以降で下痢性疾患が診断、管理、および研究されていること、特に時代遅れの培養方法に依存しない迅速で正確な診断の必要性に照らして、どのように診断、管理、および研究されているかに大きな影響を与える可能性があります。
この研究では、リバプールのゲノム研究センター（CGR）と、リバプール都市地域のライフサイエンスイノベーションゾーンの一部である新しい微生物叢と感染症（MAID）イニシアチブの戦略的役割も強調されています。
エドワード・カニンガム・オークス博士は次のように付け加えました。「私たちの結果は、RNAは、かつてはスツールテストで使用するにはあまりにも脆弱だと思っていたと考えていたため、感染がどのように機能するかについての強力な洞察を与えることができることを示しています。それは、これらの病気をより効果的に診断して治療するための新しい可能性を開くことができることを示しています。」
詳細：
Edward Cunningham-Oakes et al、1000のヒト下痢サンプルのメタゲノムおよびメタトランスクリプトームシーケンスによる感染性腸疾患の診断の強化、 ゲノム医学 （2025）。 doi：10.1186/s13073-025-01478-w
引用：高度なゲノミクス研究は、2025年5月20日に取得した、困難な下痢感染症（2025年5月20日）の検出を改善する
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#高度なゲノミクス研究は見つけにくい下痢性感染症の検出を改善します
2025-05-20 15:27:00