抽象的な
導入
2019年コロナウイルス感染症（COVID-19）のパンデミックは2019年12月に中国で始まり、2020年1月21日から2023年5月5日まで国際的に懸念される公衆衛生上の緊急事態（PHEIC）となり、世界中で多分野の混乱を引き起こした。 「検査、検査、検査」という WHO の指令を背景に、世界中で 7 億人を超える新型コロナウイルス感染症が検出され、感染症の流行に対応する診断能力の重要性が強調されています。1,2 高感度で特異的な核酸リアルタイム逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応 (RT-PCR) や一般に分子診断と呼ばれる増幅検査は、アウトブレイクへの対応に役立ち、早期発見、適切な臨床管理、およびアウトブレイク封じ込めの客観的評価を可能にし、言うまでもなく、感染拡大の抑制を促進しました。薬やワクチンの開発。
分子検査の導入に必要な設備投資は、アフリカの多くの国にとって、規模を拡大する上で大きなハードルとなっていました。この問題は、迅速な抗原検出法の出現によって部分的に克服されました。しかし、これらの安価な代替品の感度が標準以下であることは、それらが依然としてゴールドスタンダードの分子検査を補完するツールであることを意味しています。
設定
診断の柱の活動: 新型コロナウイルス検査の隆盛と衰退
分子ウイルス学研究所は、2020 年 5 月 10 日に新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) 検査のために稼働し、すぐに州の診断および公衆衛生監視の中心地となりました。4 2023 年 5 月 5 日の PHEIC 終了までに、合計 26,694 個のサンプルが処理されました。 、そのうち3535人が陽性でした。 3 年間の分布を図 1 に示します。すべてのテスト結果を関連する利害関係者に迅速に報告することは、研究所のもう 1 つの重要なタスクでした。この診断の柱は、パンデミック中に、RT-PCR を参照検査として使用して、4 つの迅速抗体診断キットと 6 つの抗原検査も評価しました。分子検査のために受け取った検体は、州内のゲノム監視に貢献する次世代配列決定のために提出されました。最後に、この柱は、SARS-CoV-2検査分野の発展に遅れないよう科学文献を定期的に評価することで、証拠に基づいたガイダンスを提供する責任を負っていた。
図1.
UBTH 分子ウイルス学研究室における COVID-19 検査件数 (2020 年 5 月から 2023 年 5 月)。サンプル量のピークは、2020年6月、2021年2月、2021年9月、2021年12月、2022年7月に発生しました。これらのピークは、明確なパンデミックの波とほぼ一致しています。連続するピーク時の検査数の減少は、パンデミックが進行するにつれて臨床検査に対する公衆衛生上の関心が薄れていることを表している。
機会
現場での検査の導入により、病院全体のパンデミック対応が強化され、患者管理、感染予防と制御、医療従事者の安全にプラスの影響を与えました。さらに、分子検査は他にもユニークな機会を提供しました。人材育成の面では、研究室のスタッフは後援された技術、安全、データ管理のトレーニングの恩恵を受け、新しいスキルと能力を獲得しました。第二に、大量の分子検査の存在により、研究者や他の協力者が病院に集まりました。たとえば、UBTH は、ナイジェリアでの迅速抗原検査キットの多施設診断評価を実施するための補助金の共同受賞者でした。また、資金提供を受けた医療従事者の感染症例管理研究を実施するため、また国内の急性発熱性疾患監視のための定点拠点としても選ばれました。
課題
サンプル量が多く、人員が限られているため、診断所要時間 (DTAT) にマイナスの影響がありました。これは、救急エリアでの症例のトリアージの場合に特に問題でした。研究所は、臨床サンプルを優先して検査プロセスを二重追跡することで対応しました。最終的に、追加の試験プラットフォームを購入したことで、すべての試験片の DTAT が大幅に改善されました。
おそらく、分子検査を維持するための最大の課題は資金調達であり、おそらく今もそうだろう。新型コロナウイルス感染症の分子検査は資本が集中しますが、この病気の公衆衛生上の重要性のため、すべての国民に無料で提供されています。試薬と消耗品はナイジェリア疾病管理センター (NCDC) によって提供されますが、特に電力、接続、保管、管理およびメンテナンスのコストの矢面に立つのは研究室と病院の管理者です。
学んだ教訓
新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) 検査の導入は困難ではありましたが、以下に列挙するような貴重な洞察をもたらしました。
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オープン PCR システムへの投資: UBTH 分子ウイルス学研究所は 2011 年から存在していましたが、HIV 検査専用の独自の、または非公開の PCR 装置しか所有していませんでした4。この装置は利用可能な SARS-CoV-2 アッセイと互換性がありませんでした。オープン PCR マシンを取得したことで、さまざまな SARS-CoV-2 アッセイによる検査を開始し、維持できるようになりました。これは、パンデミックによって引き起こされたサプライチェーンの混乱に対処するのに役立つことが判明しました。また、将来的に検査できる病原体の範囲も広がりました。
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分子診断特許のための人的能力とインフラストラクチャの両方を維持する: 施設内で HIV PCR を実施するための既存の人的能力により、熟練職員の数が少ないにもかかわらず、UBTH での 新型コロナウイルス感染症検査の開始が比較的容易になりました 4。しかし、有能な人材の不足により、暑い中での訓練に貴重な人的時間が費やされました。パンデミックの。したがって、アウトブレイク中にシームレスなタスクの移行を可能にするために、重要な集団の検査技師が分子技術のトレーニングを受ける必要がある。これを費用対効果の高い方法で達成するには、分子検査施設が稼働し続け、技術者がトレーニングを受けるために拠点から遠く離れた場所に移動する必要がなくなる必要があります。したがって、新型コロナウイルス感染症パンデミックの最中にナイジェリアで活動した分子研究所が、広範な診断ネットワークに従って、公衆衛生上重要な他の病気（ラッサ熱、ムポックス、コレラ、顧みられない熱帯病など）の検査に従事することで特許を維持することが不可欠である。 NCDC による最適化。これは各機関と政府の共同責任であるべきです。
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研究室職員の研究能力を高める：研究はアウトブレイク対応全体の重要な側面であり、効果的な診断法の開発と評価に不可欠です。研究能力の欠陥は、そのほとんどが量的なものであった（研究経験のある少数の研究室スタッフが業務への関与によって制約されていた）だけでなく、質的なもの（例えば助成金の能力の欠如）でもあったため、診断方法や戦略を評価する機会が不足していることを意味した。サンプルテストは未調査のままでした。研究室で助成金と研究能力を構築すると、学んだ他の教訓を活用しやすくなる可能性があります。たとえば、助成金は機器を調達し、公衆衛生関連の感染症の検査を実施するために使用できます。トレーニングと能力開発を補助金申請に組み込むこともできます。これは、すでに獲得した能力を維持および強化するとともに、バイオインフォマティクスやゲノム配列決定などの高度な能力を含めるように能力を多様化する方法となります。
前述の教訓は、分子実験装置、人員、研究能力に対する UBTH の戦略的投資において有益でした。例えば、経営陣は連邦政府からすべての三次病院に提供された新型コロナウイルス感染症介入資金を賢明にもMICとQuantiStudioリアルタイムPCRシステムの購入に充てた。また、私たちは NCDC と積極的に連携し、公衆衛生上重要な他の病気、特にラッサ熱の検査に当研究所を含めるよう取り組んでいます。最後に、病院全体で助成金の活動が新たに行われ、特に分子研究室がターゲットとなることが予想されます。
結論
パンデミック対応の重要な側面である検査室の準備は、新型コロナウイルス感染症のパンデミック中、政府、公衆衛生機関、医療施設、そして実際にすべての関係者に深く影響を与えてきました。パンデミックは課題をもたらしただけでなく、UBTH の既存の分子診断能力を強化する機会をもたらしました。新型コロナウイルス感染症はもはや公衆衛生上の緊急事態ではありませんが、将来のパンデミックに対する検査室の備えと対応を確保するために、感染症の分子検査能力は依然として国および地方レベルでの優先事項です。 UBTH 分子ウイルス学研究所での COVID-19 検査の導入から学んだ教訓は、人員、設備、研究開発への投資に焦点を当てた戦略計画を伝えるために活用されています。国レベルおよび大陸レベルでも同様の対応が必要です。
著者の寄稿
著者全員がこの研究を発案した。 IIO が原稿を作成しました。著者全員が知的内容を考慮して原稿を批判的に改訂しました。著者全員が最終原稿を読んで承認しました。 DEO は論文の保証人です。
謝辞
私たちは、UBTH 管理委員会と UBTH 分子診断およびウイルス学研究室のスタッフ全員の職務に対する献身的な努力に敬意を表します。
資金調達
なし。
競合する利益
何も宣言されていない。
倫理的承認
必須ではありません。
データの可用性
このペーパーの目的のために特別に生成されたデータがないため、該当しません
参考文献
3
Obaseki
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ナイジェリアにおける新型コロナウイルス感染症パンデミックに対する三次病院の準備と対応: 課題、機会、教訓
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愛してます
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SARS-CoV-2 検査のための分子診断研究所の設立: リソースが限られた環境における単一センターの経験
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© 著者 2024。王立熱帯医学衛生協会に代わってオックスフォード大学出版局が発行。
これは、クリエイティブ コモンズ表示ライセンス (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）、元の著作物が適切に引用されている限り、あらゆる媒体での無制限の再利用、配布、複製が許可されています。
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