抽象的な
オルフウイルス (ORFV) は、主にヒツジ、ヤギ、野生反芻動物、およびヒトに影響を及ぼす世界的疾患である伝染性膿痂疹 (CE) の病原体です。今回、スペイン産の 2 つの ORFV 株 (NAV および ARA) とアルゼンチン産の 2 つの ORFV 株 (HRE および CHB) の完全なゲノム配列を決定しました。これは、ヨーロッパからの 2 番目の報告、南米からの初の報告となります。ORFV の ARA、CHB、HRE、および NAV 株のアセンブルされたゲノムは、それぞれ 137,891 bp、137,160 bp、137,340 bp、および 137,214 bp の長さで、各株に 132 個の遺伝子が含まれており、高いアミノ酸同一性を示し、参照株 NZ2 と長さが類似しています。マイクロサテライト解析を実施し、宿主 (ヒツジまたはヤギ) が異なる株の分子シグネチャを決定しました。さらに、特別に選択された 32 個の遺伝子の分析により、このデータセットのヌクレオチド置換率は 3.2 x 10-5 サブサイト/年 (95% HPD 4.2X10-8 -7.6 X10-5)、中央値は 2.8 x 10-5 サブサイト/年であり、TMRCA (中央分岐時間) は 1661 年であることが示されました。ORFV 株の遺伝的特徴付けにより、疫学研究が可能になるだけでなく、診断およびワクチン向けの分子ツールの開発に向けた第一歩となります。
競合利益に関する声明
著者らは利益相反がないことを宣言している。
#ヨーロッパと南アメリカからの #つのオルフウイルス株の全ゲノム解析