新たな遺伝子分析により、COVID-19の起源は武漢市場にあることが判明

新型コロナウイルス感染症（COVID-19）のパンデミック発生初期の数週間に武漢の生きた動物を扱う市場から採取された遺伝物質の新たな分析により、新型コロナウイルスが感染した動物から人間に感染し、武漢で流行が始まったとする説が強化されたと科学者らは述べた。

の 調査結果ジャーナル「セル」が報じたところによると、研究は、1100万人以上が住む中国の都市にSARS-CoV-2ウイルスを持ち込んだ特定の感染動物を特定していない。また、華南海鮮卸売市場が パンデミックの震源地 その結果 700万人以上の死者。

しかし、遺伝子の証拠は、市場が感染拡大を引き起こすのに必要な条件を満たしていたことを示しており、コロナウイルスが研究所、農場、あるいは市内の4つの生きた動物を扱う市場のいずれかからどのようにして発生したのかを説明することがますます困難になっていると研究著者らは述べた。

「サンディエゴでゴリラウイルスが発生し、最初にサンディエゴ動物園で働いていた人々や近くに住んでいる人々に感染し、その後さらに広範囲に広がったようなものです」と、彼は語った。 マイケル・ウォロベイこの研究に携わったアリゾナ大学の進化生物学者、ジョナサン・マイヤーズ氏は次のように述べている。「この遺伝子が動物園のゴリラから来た可能性が高いと考えるのは難しくないだろう。」

パンデミックの根本原因については、初期から激しい議論が交わされてきた。武漢には、科学者がSARS-CoV-2に似たコロナウイルスを研究する政府の研究所があり、それがきっかけとなって 政治家、 国家安全保障の専門家、 深夜のトークショー司会者 そして 多くの科学者 ウォロベイ氏を含む研究者らは、ウイルスが研究室から漏れたかどうかを疑問視した。

この議論は説得力があるかもしれないが、漏洩仮説を裏付ける確固たる証拠は欠けている。一方で、漏洩を裏付けるさらなる情報が明らかになり、 科学者を説得した 関連分野の専門知識を持つ研究者らは、COVID-19を引き起こすウイルスは、SARS、MERS、インフルエンザを引き起こすウイルスと同様に動物由来であると結論付けた。

新しい結果もその傾向を続けていると、 ドミニク・ドワイヤー博士国際タスクフォースのメンバーである パンデミックの起源を調査した 世界保健機関向け。

「こうした起源に関する仮説をすべて検討すると、証拠が集まるにつれて、そのいくつかはより有力なものになる」と、最新の研究には関わっていないオーストラリアのシドニー大学およびウェストミード病院の医学ウイルス学者ドワイヤー氏は述べた。「この論文には、華南市場を通じた動物起源説を支持するさらなる証拠が含まれている」

木曜日に発表された分析は、2020年1月1日に市場が閉鎖された直後に中国疾病予防管理センターの研究者が華南市場内外から収集した数百のサンプルから収集した遺伝子データに基づいている。中国チームは、検査した環境サンプルのうち74個からコロナウイルスを検出したと、研究チームは発表している。 報告 昨年、ネイチャー誌に発表された。

ウォロベイ氏と彼の同僚たちはそのデータをさらに深く調べた。彼らは2つの異なる遺伝子配列解析技術を使用して、SARS-CoV-2の断片と動物および人間のDNAを探した。

次に、研究チームは発見した内容を広大な市場の地図上にプロットし、当初の少数の感染がどのようにして世界的な健康上の緊急事態にまで拡大したかを再現することができた。

2020年1月初旬に採取された585のサンプルのうち、コロナウイルスを含むものは市場の南西部に集中していた。そこは野生動物が檻に入れられて販売されていた場所だった。

「市場は数エーカーの広さがあり、これは市場の一角と数軒の屋台から出たものです」とドワイヤー氏は言う。「これは動物由来であることに合致します。市場を歩き回っている人々から出たものであれば、どこにでも見つかるはずです。」

研究の著者らは、ある市場の屋台が「目立っていた」と記している。その屋台では、少なくとも1台のカート、鉄製の容器、地面、毛や羽毛を取り除く機械など、複数の場所でSARS-CoV-2の証拠があった。研究者らはそれを「野生動物屋台A」と名付けた。

さらに2020年1月末に市場の排水システムから60個のサンプルが採取された。研究者らは、野生動物飼育場Aの前にあったものを含む4個からコロナウイルスの遺伝的証拠を発見した。

この排水溝は2月中旬でもSARS-CoV-2の検査で陽性反応を示していた。研究者らは、その下流にある2つの排水溝も同様で、野生動物飼育場Aからの流出水で汚染されていた可能性があると記している。

コロナウイルスが検出された売店のサンプルには、犬、ウサギ、シベリアタケネズミ、マレーヤマアラシ、ハクビシンなど、さまざまな動物のDNAも含まれていた。最も多かったのはタヌキのDNAで、近くのゴミ収集車からも一部が検出されたが、こちらもウイルス検査で陽性反応が出た。

自然界に存在するSARS-CoV-2に最も近い既知の類似物は、循環するコロナウイルスである。 馬蹄形コウモリ 中国南部、ラオス、ベトナム、 センザンコウ 中国南部から採取されたものだ。しかし、華南市場のサンプルからはコウモリやセンザンコウのDNAは検出されなかった。

タヌキ、ハクビシン、シベットネズミ、マレーヤマアラシ 伝達した コロナウイルスを撃退すると研究著者らは指摘した。彼らは武漢でそのようなことができたのだろうかと疑問に思った。

竹ネズミやマレーヤマアラシがSARS-CoV-2に感染するかどうかは不明だと研究著者らは書いている。ハクビシンがウイルスに感染するという確固たる証拠はないが、動物の細胞株は感染しやすい。 実験室での実験。

一方、タヌキは SARS-CoV-2を感染させ、感染させるそして、野生動物飼育舎 A では、彼らが最も多く生息していた動物でした。

研究者たちは、タヌキのDNAを詳しく調べ、タヌキが中国南部から来たのかどうか、またそこでコウモリと遭遇した可能性があるのかどうか調べた。はっきりとは分からなかったが、中国北部の毛皮農場に生息していたタヌキとの関連は否定できた。

ウォロベイ氏と彼の同僚は、野生動物の飼育場で検出されたSARS-CoV-2以外の動物ウイルスも研究し、感染した動物がどこから来たのかの手がかりが得られるか調べた。

華南市場のジャコウネコに感染したコブウイルスは、キクガシラコウモリやセンザンコウの生息地に近い四川省や広西チワン族自治区で売られている動物から検出されたウイルスと近縁関係にある。また、竹ネズミに感染したベータコロナウイルスは、市場の売り手が動物を調達していることが知られている南部の2つの省のうちの1つである広西チワン族自治区の竹ネズミ農場に近縁種がいた。

「これらの発見は、感染した動物が中国南部から武漢へ何らかの形で移動したことを示唆しており、それがSARS-CoV-2の出現にもつながった可能性のある貿易経路だった」と研究著者らは記している。

これを明らかにするには、中国の動物からサンプルを収集する現地調査を含むさらなる調査が必要になるだろうと、 フローレンス・デバレパリのフランス国立科学研究センターの進化生物学者で、この研究の主任著者であるウォロベイ氏は、今後もこの研究を継続する予定だと語った。

ドワイヤー氏は、市場の動物がどこから来たのか、ひいてはウイルスがどのようにして市場に侵入したのかを突き止めようとする努力を称賛した。

科学者らによると、2つ目の証拠も、パンデミックがいわゆる人獣共通感染症起源であるという仮説を裏付けているという。

2020年1月1日に華南市場で収集されたサンプルの中から、研究者らはほぼ完全なSARS-CoV-2ゲノムを4つ特定することができた。そのうちの1つはいわゆる系統Aからのものであり、他の3つは近縁の系統Bからのものである。

研究者らは、これらのウイルスが動物から排出されたのか、人間から排出されたのかは特定できなかったが、系統Aのサンプルは、2019年12月中旬に従業員が医師の診察を求めた屋台から採取された。それはCOVID-19が病気として認識される数週間前のことだったが、世界保健機関の報告書では、その後、この従業員は初期感染の疑いがあるとされていた。

市場に両方の系統が存在することを確認したことで、研究チームはゲノムを比較し、2つの系統が分岐した時期と、最も最近の共通祖先がどのようなものであったかを遡って解明することができた。研究チームは6つの候補を挙げたが、そのうちのいくつかは他の候補よりももっともらしいものだった。

最も可能性の高い4つの候補のうち1つが正しい可能性は99％あり、その4つにはすべて重要な共通点があった。それは、パンデミック全体の最も最近の共通祖先と「同等または同一」だったと研究リーダーは述べた。 アレクサンダー・クリッツ＝クリストフ独立した計算微生物学者。

研究者らは、もしこのアウトブレイクが華南市場で始まったとしたら、このような結果が予想されると述べた。そのシナリオでは、ウイルスに感染した動物が11月か12月初旬に市場に到着した。その後、ウイルスは屋内で密集した飼育動物や、その飼育者に広がった。こうした状況で、ウイルスは 何度もチャンスが必要だった 人々に定着し、人口密度の高い都市の新たな宿主の間で広がり始めます。

一方、この証拠すべてを、コロナウイルスが中国に侵入したという一貫したストーリーに当てはめるのはますます難しくなってきている。 輸入冷凍食品経由 （中国政府が主張しているように）あるいは ウイルス学研究室からの脱出 ドワイヤー氏は、（米国の諜報機関の一部のメンバーが提案したように）バイオセキュリティプロトコルが緩いと述べた。

「研究室からの漏洩説や冷凍食品説を裏付ける証拠は何もなかった」と同氏は述べた。「動物と市場に関する仮説を強めるだけだ」

科学者がコロナウイルスを研究するウイルス学研究所がある都市でパンデミックが始まったことを考えると、 尋ねるのは理にかなっている デバール氏は、それが単なる偶然ではないのか、また有罪の証拠が隠蔽されているのではないかと疑問に思うと述べた。

「私たちの多くは、このアイデアに非常に前向きでした」と彼女は語った。「しかし、データが蓄積され、それらはすべて同じ方向、つまり市場を指し示しています。」

「科学では最終的な答えが出ることはほとんどない」と彼女は付け加えた。「『私たちが持っているすべてのデータを考慮すると、これが最も可能性の高い解釈のようだ』と言うのです」