ニューヨーク – 複数の新たな遺伝学的および地理空間的証拠により、初期のSARS-CoV-2症例と武漢の華南海鮮卸売市場での野生動物の取引との関連が示唆された。
この結果は、コロナウイルスを研究していた近隣の研究所からの偶発的な漏洩ではなく、市場がパンデミックの発生源であると示唆した過去の疫学研究と一致している。
「広範な疫学的証拠は、華南市場での野生動物の取引がCOVID-19パンデミックの起源として最も可能性の高い経路であることを裏付けている」と、ソルボンヌ大学の研究者で共同筆頭著者のフローレンス・デバール氏とその同僚は論文で述べた。 勉強 出版年 細胞 木曜日に。
研究チームによると、以前の研究では、2019年12月に武漢で報告された最初の174件のCOVID-19症例のうち約3分の1が、市場で働いたり訪れたりした個人に関連していた。同様に、過去の研究では、市場周辺の地理的地域で予想よりも高い肺炎による死亡率が指摘されており、その後の研究でもSARS-CoV-2への曝露に対する血清陽性率が高いことが示された。
「初期の症例の調査結果の一部は、市場に関連した症例を優先的に特定できた可能性があるが、華南市場との関連が確認されていない初期の症例の居住地の地理空間分析により、地理的な近さが症例の基準として使用されていなかったにもかかわらず、彼らが予想外に市場の近く、市場を中心に住んでいたことがわかった」とデバール氏と共著者は説明した。
新しい研究で、デバール氏とソルボンヌ大学、アリゾナ大学、スクリプス研究所などの同僚は、逆転写定量PCR、メタゲノム配列決定、SARS-CoV-2ゲノム解析、系統学、地理空間マッピングを使用して、2020年1月1日と1月12日に中国CDCが華南市場で収集した800以上の環境サンプルと、2020年3月下旬までに収集された追加サンプルを評価しました。
研究者らはこれらのサンプルで、系統Aと系統Bとして知られる初期のウイルス系統の両方からSARS-CoV-2を特定した。また、ほぼ完全な4つのSARS-CoV-2ゲノムを使用して、華南市場に存在するウイルス分離株の最新共通祖先（MRCA）が、COVID-19パンデミック全体からの遺伝的に特徴付けられた分離株の膨大なコレクションのMRCAと一致していることを示した。
「華南市場に関連するSARS-CoV-2のMRCAがパンデミックのMRCAと同等であることは、市場での感染発生の起源の時期が、パンデミック全体の起源の時期と遺伝的に区別できないことを証明している」と著者らは説明した。
研究チームは地理空間パターンから、SARS-CoV-2の配列が市場の南西部の地域、特に野生動物が売られていた屋台Aと呼ばれる1軒の屋台とその周辺に集中していることを実証した。
研究チームはさらに、疑わしい屋台の周辺地域でSARS-CoV-2陽性サンプルが濃縮されていることを示しており、地面、動物を運ぶカート、毛や羽毛を除去する機械、近くの排水溝からのサンプルでウイルスが検出された。近隣で野生動物を販売していた別の屋台でもSARS-CoV-2陽性サンプルが検出されたが、そこではウイルスはあまり一般的ではないようだった。
研究者らは、華南市場の動物がウイルス物質を排出する能力があるという仮説と一致して、市場のサンプルでタヌキのアムドパルボウイルス、タケネズミのベータコロナウイルス、ジャコウネコのコブウイルスから、イヌやハリネズミのコロナウイルス、ポリオーマウイルス、インフルエンザAに至るまで、さまざまな既知の動物ウイルスを追跡した。
「これらの結果は、市場に生きた動物が存在したという証拠をさらに裏付けるものであり、SARS-CoV-2の潜在的な野生動物宿主が他のウイルスを積極的に排出していた場所であることを証明するものである」と著者らは指摘した。
中間宿主種はまだ特定されていないが、タヌキのDNAは華南市場で特に多く見られ、特にSARS-CoV-2を含むサンプルが最も多く出回った屋台で多く見られたと著者らは説明した。
「中国CDCチームが到着する前に、主要な動物種の多くが駆除されていたため、動物が感染していたという直接的な証拠はない」とデバール氏は声明で述べた。
「環境サンプルの中にこれらの動物のDNAとRNAのゴーストが見られ、その中にはSARS-CoV-2が見つかった売店にもいくつかある」と彼女は説明した。「市場に感染した動物がいるというシナリオでは、これが予想されることだ」
アリゾナ大学の研究者で共同執筆者のマイケル・ウォロベイ氏は声明の中で、「COVID-19のパンデミックを受けて、「研究室の安全性に対する注目が高まっている」が、「今回のような人獣共通感染症のシナリオが再び起こる可能性を減らすために、あまり対策が講じられていない」と指摘した。
#環境サンプルのSARSCoV2遺伝子研究によりパンデミックと武漢市場野生動物取引との関連が判明