医療スタッフが活動し、医師が患者を診察している病棟の写真は、健康促進における感染管理とチームワークの役割を強調しています。
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毒素産生菌の院内感染 クロストリディオイデス・ディフィシル 感染制御において重大な懸念事項である。この細菌は、通常、ヒトの腸内に生息しており、特に患者が医療従事者と密接な接触がある場合に拡散するリスクがある。追加の培養検査とドラフト全ゲノム配列（WGS）による一塩基多型（SNP）分析により、特に頻繁な部屋の変更や繰り返しの入院の場合に、病棟内で気づかないうちに感染が広がっていることが明らかになった。WGSベースの分析を使用して、 それは難しい 伝達は感染制御を管理するための効果的な戦略となる可能性がある。
38 株が特定され、11 のシーケンス タイプ (ST) に分類されました。最も多かったのは ST81 (n = 11) で、続いて ST183 (n = 10)、ST17 (n = 7) でした。SNP 分析により、院内感染が疑われる株のクラスター (SNT) が明らかになりました。ドラフト WGS では 5 つのクラスターが特定され、38 株のうち 16 株がこれらのグループに属していました。
調査員によると、「積極的な追加培養検査を実施することで、 それは難しい 分離された株の遡及的WGS分析を実施することで、日常的な感染制御対策の有効性を検出し監視するのに役立つ可能性がある。」
主なポイント
院内感染を調べるために それは難しい 研究者らは、単一の施設で細菌の遺伝的関係を調べた。これは、ドラフトWGSとコアゲノムのSNP分析、および患者の病棟と部屋の変更に関するデータを通じて行われた。この遡及的研究には、2014年4月から2015年1月の間にそれぞれ異なる患者から採取された38の菌株が含まれていた。
ST81には2つのクラスター（ST81-SNT-1とST81-SNT-2）、ST183には2つのクラスター（ST183-SNT-1とST183-SNT-2）、ST17には1つのクラスター（ST17-SNT-1）がありました。最大のSNTクラスターであるST183-SNT-1には、病棟A、B、Kに関連する5人の患者が含まれていました。Pt08と指定された患者は、病棟Bで7回部屋を変えており、最も頻繁に部屋を変えた患者でした。同じく病棟Bにいた患者Pt36とPt10は、研究中に複数回の入院と退院を経験しました。研究者らはまた、「ST183で隔離された患者は、感染または伝染するリスクが高いことが示唆されている」と指摘しました。 それは難しい頻繁な部屋の変更が原因の可能性があります。」
この研究には3つの限界がある。それは、C.diffの院内感染の観察のみに焦点を当てた単一施設の後ろ向き研究であり、 それは難しい 研究は、CDI（慢性気管支炎）や抗菌薬の使用に関するデータの欠如、CDI患者と同じ部屋にいた無症状患者のスクリーニングの欠如、また、無症状感染が感染制御や医療費に与える影響の評価も行われていない。各患者から分離された最初の株のみが分析されたため、患者が複数の遺伝的に異なる菌株を保有している可能性を見落としている可能性がある。 それは難しい。
含めるCDC の WGS の使用により、小規模なアウトブレイクの検出が改善され、報告不足が浮き彫りになりました。これは、この研究が病院内での気づかれなかった感染を明らかにした方法と似ています。CDC が 2018 年に WGS を導入した後、調査員は、米国の食中毒のアウトブレイクにべき乗分布を当てはめると、重大な検出不足と報告不足が明らかになったことを発見しました。2
1998年から2017年までの期間、このモデルに基づく予測よりも毎年788件少ない小規模なアウトブレイクが確認されました。しかし、2018年にWGSが導入されたことで検出率が向上し、2018年と2019年には毎年365件の小規模なアウトブレイクが確認され、予測よりも少なくなっています。2
両研究は、感染制御の強化と感染管理におけるゲノム手法の重要な役割を強調し、公衆衛生の実践における革新的なアプローチの必要性を強調しています。
参照
1726683812
#全ゲノム解析による病院内でのクロストリジウムディフィシル感染症の伝染の解明
2024-09-18 18:08:59