著者訂正: サンプル収集によってもたらされる相対的および絶対的なマイクロバイオーム測定におけるバイアスの定量化

この論文の初版では、16S rRNA 遺伝子標準曲線に 10 倍の誤差がありました。これは、標準プラスミドの 1:10 連続希釈誤差が原因と考えられます。誤差は、16S rRNA 遺伝子標準曲線と、当グループにおける原核生物濃度のその後の研究との比較から判明しました。この矛盾は Boryana Garcia Doyle によって発見され、その後、当論文の訂正に協力し、現在は著者として追加されています。誤差を修正するために、すべてのサンプルを 16S rRNA qPCR ワークフローに再度通し、以下の変更を加えました。1) 各 16S rRNA 標準プラスミドについて、プラスミドの連続希釈を 3 回ずつ独立して生成し、qPCR 実行ごとに合計 6 つの標準曲線を作成して、標準曲線を確認しました。2) サンプルは、標準曲線の追加複製に必要な追加のウェルに対応するため、元の原稿のように 3 回ではなく qPCR テクニカル デュプリケートで実行されました。 報告された測定値は更新されており、論文の結論はほぼ変更されていない。原核細胞数の結論を1.86 × 10に更新した。¹³この結果は、以前に公表された推定値と一致しています。さらに、保存されていない即時凍結サンプルと即時凍結され Zymo 保存されたサンプルの間で、総原核生物濃度に有意な差があることがわかりました。図 4、5、補足図 6～8、補足データ 1～3、補足表 4 は、これらの改訂を反映するように更新されています。比較のために、元のバージョンとテキスト編集のリストは、この改訂のオンライン バージョンで入手できます。

補足情報は、この改正のオンライン版でご覧いただけます。