私の友人であるあなたは、科学者が「ホロビオンテ」と呼んでいるもの、人間の細胞で構成された生物、そしてあなたの体内とあなたの体の上に住んでいる多数の微視的種です。
これらの微生物の多くは細菌です。おそらく、あなたの腸内微生物叢に存在する細菌の多様性が、免疫系から心まであなたの健康にどのように影響するかを聞いたことがあるでしょう。
しかし、ウイルスはあなたの体にはるかに豊富です。多くの人が私たちに一時的に感染し、しばしば症状を引き起こし、それから私たちの人生の残りのために非アクティブな形で持続します。
今日の生物学者は、私たち一人一人に住んでいる細菌の10倍のウイルス、または約3800,000億人のウイルスがあると推定しています。 アメリカ科学 報告。それでも、この膨大なウイルスのコレクションが人間の健康と病気に貢献する方法は、主に謎のままです。
国立衛生研究所（NIH）は、Human Viromeプログラムと呼ばれる野心的なプロジェクトでこれを変更したいと考えています。彼は、人間のゲノムプロジェクトが最初の完全なレベルのヒトDNAを引き出したのと同じように、身体生態系の一部である多くのウイルスをマッピングしようとしています。さらに、このプロジェクトは、このウイルスのセット（ビロームとして知られる）が、予期せず人間の健康にどのように影響するかを理解することを目的としています。
メモリアルスローンケタリングがんセンター（MSK）の研究者は、この重要な取り組みの重要な貢献者です。
「地球上には、宇宙の星よりも多くの個々のウイルスがあります。 MSKのコンピューター生物学者であるCaleb Laune博士は、プロジェクトに取り組むために5年間で500万ドルの補助金を受け取ったと述べています。 。 「しかし、大きな問題は、あなたが露出したさまざまなウイルスとあなたの独自の遺伝的フットプリントやその他の要因と組み合わせて、癌を含むさまざまな疾患を発症する可能性に影響を与えます。 »»
MSKは、NIH Common Fundの人間ビロームプログラムの一部として1億7000万ドル以上の資金を受け取る16の機関の1つです。
ウイルスに関するほとんどの研究は、明らかな疾患を引き起こす少数のウイルスに焦点を当てていますが、私たちと共存し、既知の疾患に関連していない他の多くのウイルスにはあまり注意が払われていません。 »»
Caleb Laune、PhD、MSK Computational Biologist
ウイルスに関するデータの金鉱山
ヒトゲノムプロジェクトの主な結果の1つは、遺伝的配列決定の開発でした。今日、たとえば、がんの人が腫瘍のDNAをMSK-umpact.®のような検査で配列することが一般的であることが一般的です。
「この最初のヒトゲノムのシーケンスは約30億ドルかかります」とMSKのSloan Kettering Instituteの研究者であるLaune博士は述べています。 「過去20年にわたる技術の進歩のおかげで、全ゲノムのシーケンスのコストは劇的に低下しました。これにより、一般にアクセス可能なDNAシーケンスの大規模な標準の開発につながりました。これには、検出されたウイルスのDNAも含まれています。これらのそれぞれに感染しました。 ITメソッドがこのデータを適切に分析して、ウイルスを体系的に理解することができたのはごく最近です。
補助金の間、ラロー博士と彼のチームは、数十万人の個人のシーケンスデータを分析するための技術を開発し、身体にあるウイルスの署名を特定して定量化します。この情報は、これらの個人の健康、人口統計、地理に関する関連データと組み合わさって、「デジタル人間のビローム」を作成します。
最終的に、目的は、人が被ったウイルス感染、個々の遺伝的変動、および健康に対する可能性のある結果との間の潜在的なリンクを明らかにすることです。
「各人は、これらの現在または「風土病」ウイルスの多くに感染しています」とラロー博士は説明します。 「しかし、人々は同じ感染症に対して異なって反応します。私たちのアプローチは、人間のビロームが人間の健康と深く結びついていることを発見するのに役立つように設計されています。 »»
病気を予防するためにウイルスを理解します
Laune Laboratoryでのポストドクターの財布、博士号、Erin Cummingは、プロジェクトに関する彼の仕事に熱心です。彼女は、健康な人の豊富な潜在ウイルスを研究する際に、人々が病気になるのを防ぐ機会を発見することを望んでいます。 （MSK Postdoc Slam 2024での彼の研究に関する彼の3分間のプレゼンテーションを見てください。）
カミング博士が濃縮されるウイルスの1つは、ヒトヘルペスウイルス6（HHV-6）です。
「それは、生殖細胞に統合し、親から子供に伝染することができる唯一のウイルスです」と彼女は言いました。 「これは、一部の人々が体の各細胞にウイルスのDNAのコピーを持って生まれ、生涯に潜在的に再活性化される可能性があることを意味します。 »»
カミング博士は、グローバル標準のシーケンスデータが、HHV-6を遺伝的に伝達するこの異常な能力を促進する要因に光を当てることができることを望んでいます。
ラロー博士が率いる以前の研究では、HHV-6潜在感染症ががんのためにCAR-T細胞を投与され、見当識障害やその他の症状を引き起こすことができることを明らかにしました。このプロジェクトは、治療が潜在的なウイルス感染の再活性化を刺激する可能性のある同様の予期しない例を特定することができます。
「私たちが構築しているものは、多くの種類のウイルスについて具体的な質問をするのに役立ちます」とラロー博士は付け加えます。
たとえば、Epstein-Barrウイルスはヘルペスウイルスファミリーの別のメンバーです。これは、世界のヒトに感染する最も一般的なウイルスの1つです。病気になる人は一般に数週間で回収されますが、少数が多数の硬化症、リンパ腫、または他の種類の癌を発症する可能性があります。科学者はその理由を理解し始めたばかりであり、彼らの結果はウイルスワクチンの発生の潜在的な利点を強調しています。
ベッドサイドからベンチ、バック
「私たちは、研究室の研究の知識を患者のベッドサイドに渡す必要性について多くのことを話している」とカミング博士は説明する。 「しかし、ループを完成させることが重要です。患者のベッドサイドで重要なことを学び、それを実験室に送信し、学んだことを患者に適用します。 »»
MSKの研究チームは、ウイルスと健康データの間の予期しない相関を発見するために特に適切に配置されます。
「私たちは、さまざまな種類のウイルスによって引き起こされた病気を発症する人とその理由を知りたい」とラロー博士は付け加えます。 「私たちが発見したと信じているのは、ウイルスが病気Bを引き起こしていると言っているだけではありません。代わりに、ウイルス感染や他の多くの複雑な要因がいくつかの疾患を悪化させたり保護したりする可能性があります。私たちの賭けは、これらの複雑な要因の星座を理解し始めることができる、高度で非常に膨大なコンピューターデータセットの使用のおかげです。
#疾患の予防と治療を改善するためにヒトビロムをマッピングする