画期的な暗黙のアルゴリズムは、診断、がんの治療における新しい約束を提供します

VCU Massey Comprehensive Cancer Centerの研究者は、がんの治療と薬の処方の両方において、患者に最適な選択肢を決定するための革新的なツールを提供できる新しいアルゴリズムを開発しました。 Nature Communicationsで最近公開されたように、Jinze Liu、Ph.D。、およびKevin Byrd、DDS、Ph.D。は、細胞マーカー発現プロファイルに基づいてセルアイデンティティを割り当てる多重化イメージングデータ（Tacit）からの細胞タイプのしきい値ベースの割り当てを作成しました。暗黙は、細胞の識別時間を1か月以上からわずか数分からわずか数分から削減し、研究者に貴重な時間とリソースを節約します。

TACIT-マッセイの研究メンバーであり、VCU公衆衛生学部の生物統計学部の教授であるLiによって開発されたLiと、VCU DentistryのVCU School School of Dentistryの口頭および頭蓋顔面分子生物学の助教授であるByrdは、脳のように蒸留帯のように蒸留孔のように蒸留溝のような主要な携帯システムを介して500万を超える細胞からデータを使用します。既存のモデルと比較した場合のスケーラビリティ。多くの場合、マーカーセットが限られているため、予想される細胞集団を分離する力が欠けています。

「私たちは人工知能を使用して効率と診断の精度を高めています」とLiu氏は述べています。 「そして、より多くのデータを得るにつれて、患者の肯定的な結果を増やすTacitの能力は増加するだけです。」

彼らの出版物で、LiuとByrdは、暗黙がどのように精度とスケーラビリティで3つの既存の監視されていない方法よりも優れているかを実証し、同時に細胞タイプと状態を統合して新しい細胞関連を明らかにしました。 Tacitは、遺伝的データやタンパク質データなどのさまざまな種類のテスト間で強い一致を示し、結果をより信頼できるものにしました。患者の場合、これは診断を早く診断したり、不必要な治療を回避したり、役立つ可能性が高い臨床試験と一致することを意味します。そして、医師にとって、それは体の中で実際に何が起こっているのかを見るための強力な方法を提供します。

暗黙の有益なアプリケーションは幅広いものです。

「科学者としての私たちの目標の1つは、臨床試験のための優れた空間バイオマーカーを特定して、登録される前に試験に対する患者の反応を予測できるようにすることです」とLiuは述べました。 「私たちはすでに複数の主任研究者と協力しています [VCU’s] 空間生物学を臨床試験に含めるキャンパスと暗黙は、そのガイダンスを提供して、臨床試験患者が可能な限り最高の治療を受けていることを確認できるようにすることができます。」

Byrdは、「Tacitを使用して適切な患者を試験に参加させることができます。そして重要なことに – 間違った患者を試験に入れないでください。今は、そのための非常に良いツールはありませんが、これは非常に強力です。」

LiuとByrdは、アルゴリズムがRNAマーカーを利用してケアを促進することができる薬理環境で暗黙の利点も見られます。

「私たちには大きなリポジトリがあります [FDA] 承認された薬物は、組織サンプルにマッピングできます。あなたが患者に言うことができると想像してみてください、 ‘ここにすでにあります [FDA] 承認された薬。」そのため、患者は、必要とされていない、またはそれほど多くの利益を見ていないかもしれない新しい治験薬の試験の一環として募集されません。」

さらに、Tacitは複数の空間生物学アプリケーションで動作し、LiuとByrdが既存のデータセットに基づいてアルゴリズムの作業をさらに強化できるようにします。 「私たちは時々、暗黙はロゼッタの石のようなものだと冗談を言っています」とバードは言いました。 「これらすべての異なるデータ型がすべて同じ言語になる方法を見ることができます。私たちにとって、私たちはそれに基づいて構築できます。タンパク質から臓器系、さまざまな疾患の種類まで、多くの方法で暗黙を使用する大きな機会があります。」

LiuとByrdの作品は、スライドプロテオミクスと転送プロテオミクスの両方をキャプチャし、2つの異なる機器をリンクしてセルマルチオミクスを作成し、研究者が一度に複数のマーカーを研究できるようにする新しい技術を実証しています。以前は、研究者はシングルセルOMICのみを利用できました。

Huynh Kla、Tyc KM、Matuck BF、Easter QT、Pratapa A、Kumar NV、WordPérezP、Kulchar RJ、TJF Prassels、Souza D Weaver、Qu X、Soares Junior Lav。 BM、KMスキル、Liu J.
暗黙を利用する空間的マルチオミクスにおける細胞タイプと状態のデコンボリューション。
一般的なナット。 2025 4月21日; 16（1）：3747。doi： 10.1038/s41467-025-58874-4