著者の所属: イスラエル、ラマトガンのシバ医療センター (NS Zuckerman、Y. Lustig、K. Friedman、T. Kushnir、V. indenbaum、E. schwartz)。テルアビブ大学、テルアビブ、イスラエル (G. Choshen、Y. Lustig、O. Halutz、E. Schwartz)。メイア医療センター、イスラエル、クファルサバ（G. Choshen、A. Shoykhet）。ソロカ大学医療センター、感染症研究所、イスラエル、ベエルシェバ (H. アズレー)
デング熱ウイルス (DENV) は、世界中で最も蔓延しているアルボウイルスです。その発生率は過去 20 年間で 10 倍に増加しました。これは主に気候変動とグローバリゼーションによるものです (1）。東南アジアやアメリカ大陸での伝播は十分に記録されていますが、ヨーロッパを含む非風土病地域でも土着性の出現がますます報告されています。
DENV-2 症例の地理的起源を調査するために、我々は DENV 全ゲノム配列決定を実行しました。私たちは、特定の全ゲノム プライマーを使用して DENV-2 を捕捉しました (https://grubaughlab.com/open-science/amplicon-sequencing); Nextera-XT を使用してシーケンス ライブラリを準備し、Illumina NovaSeq で実行しました (https://www.イルミナ.com）。我々は、DENV-2参照ゲノム(GenBankアクセッション番号NC_001474.2)にマッピングすることによってコンセンサス配列を生成し、得られた配列をGenBankに寄託しました(付録表)。この研究におけるサンプルの使用は、Sheba Medical Center 治験審査委員会によって承認されました (承認番号 SMC-6190-19)。
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形。イスラエルに帰国した旅行者からのDENV-2出現の分子的証拠の研究における、紅海地域におけるデングウイルス（DENV）血清型2（DENV-2）循環の疫学、系統発生、および地理…
過去20年間、 ああ。エジプトの エジプト、特に紅海沿岸で蚊の個体数が増加しており（図、パネルB）、デング熱の発生と相関している。しかし、シナイ島に関する昆虫学的データは存在しません。乾燥した気候は蚊の生存に課題をもたらしていますが、1つのリゾート地での感染者の集中は、おそらく都市部の微小生息地によってサポートされている地域適応を示唆しています(9）。海上および航空旅行により、繰り返しの導入が促進される可能性があります。 ああ。エジプトの 蚊とDENVが紅海地域に侵入。しかし、紅海の港湾都市におけるDENV-2の発生パターンは、海上交通が蔓延の主な要因であることを裏付けています(6、7、10）。最近デング熱が発生したハルガダからシャルム・エル・シェイクまでの毎日のフェリーが特に関連性があるかもしれない（図、パネルB）。 2019年のジザンの流行とサウジアラビアからの株（1992年から2014年）の遺伝データは、マレーシア、シンガポール、韓国、中国からの株と遺伝的に類似した輸入されたDENV-2変異体に関連する複数の導入をさらに示唆している（6）。 1992年から2014年にかけてサウジアラビアで分離されたDENV-2株の追加分析により、ハッジとウムラの巡礼者が最も多い国であるインドネシア、パキスタン、インドのウイルスが強力にクラスター化していることが明らかになった（10）。実際、系統解析により、我々のデング熱配列がパキスタンからの最近の株に最も近いことが示されています。しかし、エジプトと近隣地域の配列が不足しているため、ウイルスの起源、循環、分布に関する推論が制限されており、観察された変動はアンダーサンプリングと未検出症例の追加を示唆しています。
シャルム エル シェイクのさまざまな地域で 3 か月間で 4 件の症例が報告されたこの報告は、DENV-2 の伝播が継続していることを示唆し、ベクターの監視と制御の強化の重要性を強調し、公衆衛生当局に警告を発しています。提示された遺伝データは、地域の DENV 配列報告におけるギャップに対処するのに役立ち、その分子疫学と起源の理解に貢献する可能性があります。
ザッカーマン博士は、イスラエル保健省中央ウイルス研究所のバイオインフォマティクスおよびゲノミクスセンターを率いており、テルアビブ大学公衆衛生学部に所属しています。彼女の研究は、ウイルス病原体の研究におけるゲノム監視、分子疫学、バイオインフォマティクスの応用に焦点を当てています。
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