新生児集中治療室（NICU）内で時間を過ごしたことがある人なら、それが過酷なものであることを知っているでしょう。
これらの病棟で世話される小さな赤ちゃんにとって、感染症は致命的になる可能性があります。病原体の蔓延を防ぐために細心の注意が払われていますが、依然として流行は発生しています。
従来、NICU 内でのアウトブレイクの検出は、複数の赤ちゃんが同時に病気になった場合にのみ、事後対応的に行われてきました。
私たちの研究 は、発生を早期に検出し、より多くの赤ちゃんを脅かす前に細菌を撲滅するために、全ゲノム解読技術の使用を進めています。
事後対応型からプロアクティブ型へ
NICU のアウトブレイク監視には、通常、病気の発生率を監視し、病棟内で蔓延している病原体を示す可能性のある急増と長期的な傾向を特定することが含まれます。
潜在的なアウトブレイクが特定された場合、細菌を培養し、遡及的に配列決定して、それらが病棟内での共有感染源または伝播に関連付けられるかどうかを判断する場合があります。
ウェリントン地域病院は、NICU における感染監視のアプローチを変更しました。乳児は病気になるのを待つのではなく、私たちが環境科学研究所で開発したのと同じシーケンス技術を使用しています（ESR）新型コロナウイルスのパンデミック中のゲノム接触追跡用。
ユニット内の乳児は、日常診療の一環として診断用綿棒サンプルを採取されます。これらのサンプルから重要な細菌が培養された場合は、それらの配列が即座に解析され、ほぼリアルタイムで感染の可能性が特定されます。これにより、状況を注意深く監視し、新たな流行に迅速に対応できるようになります。
ゲノム配列決定により、NICU チームは乳児が病気になる前に感染性細菌を監視できるようになります。
ゲッティイメージズ
特定の細菌株を保有するすべての乳児が重度の感染症を経験するわけではないため、この積極的なアプローチにより、乳児が病気になる前に感染の発生を検出できます。
このレベルの詳細により、正確な感染モニタリングと、アウトブレイク制御に関する情報に基づいた迅速な決定が可能になります。
ケーススタディ
この変化は最近、積極的なゲノム監視によって示されたときにテストされました。 NICUにいる乳児2人が眼感染症を患っていた メチシリン耐性の珍しい株である同じ微生物によって引き起こされる 黄色ブドウ球菌 (MRSA）。
MRSA は一般的な抗生物質に耐性があることで知られており、病院内では特に危険です。
現場での塩基配列決定により、2つの症例には関連性がある可能性が高いことが示されました。優先事項は、他の乳児が影響を受けているかどうかを確認し、病原体の蔓延をできるだけ早く制限することでした。 NICU の乳児のスクリーニングにより、さらに 6 人が同じ株の MRSA を保有していることが判明しました（ただし、重篤な疾患を患っている人は一人もいませんでした）。
これは、これらの乳児を迅速に隔離し、他の乳児が重大な感染症を発症する前に流行を抑えることができることを意味しました。ゲノム接触追跡者としての ESR の経験は、これらの感染がユニット内でどのように広がるかを証明するのに役立ちました。
アウトブレイクへの対応にはリソースが必要であり、感染の最初の確認とその感染経路から保護者とのコミュニケーションに至るまで、複数のステップが必要です。
感染監視に対するこの積極的なアプローチにより、早期警告システムが提供されます。これは、NICU チームがアウトブレイクが進行中であると確信し、それを封じ込めるために迅速に行動できることを意味します。
ニュージーランドのMRSA
ゲノム配列決定の力は、当面のアウトブレイク制御を超えて広がります。
研究室で生成されたゲノムデータと国の監視プロジェクトで収集されたゲノムデータを比較することで、私たちのチームは、眼の感染症を引き起こす菌株が1990年代初頭に出現した可能性があることを示すことができました。
この株は、第一選択の抗生物質を回避するために必要な遺伝子をゆっくりと蓄積しており、アオテアロア・ニュージーランドにおける抗生物質耐性菌のリスクを裏付けています。
データは、牛乳タンクからの細菌と病院の乳児からの細菌が、ある時点で共通の祖先を共有した可能性があることを示唆しています。
今後の焦点
微生物の複雑な世界を解明し続けるにつれて、全ゲノム解読のようなツールは、感染症との進行中の戦いに希望をもたらしてくれます。ウェリントン地域病院の NICU での取り組みはまだ始まったばかりです。
最も弱い立場にある新生児の保護から、家畜と入院患者の間のありそうもない関係の解明に至るまで、ゲノム技術は感染症との闘い方を変えています。
この技術が進化し続けるにつれて、一度に 1 つの DNA 配列が公衆衛生を守る上でますます重要な役割を果たすことが約束されています。
抗生物質耐性の増大と新たな病原体に直面して、感染制御に対するこの積極的なゲノミクスに基づいたアプローチが私たちの最善の防御策となる可能性があります。
Max Bloomfield と Awanui Labs のチーム、Emma Voss と Livestock Improvement Corporation のチームの貢献に感謝します。
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#新型コロナウイルスを追跡するために開発されたゲノム解読が集中治療室にいる赤ちゃんを感染症から守っている
2024-10-20 19:05:00