最近の ランセット微生物 この研究は、免疫不全患者における宿主内の進化と長期にわたる重症急性呼吸器症候群コロナウイルス 2 (SARS-CoV-2) 感染に関連する危険因子を調査しています。
勉強： オミクロン期における免疫不全患者における SARS-CoV-2 の排出と進化：多施設共同の前向き分析。 画像クレジット: Sabrewolf / Shutterstock.com
背景
免疫不全患者は、十分な免疫を獲得していない可能性があり、ワクチンによる防御が低いため、SARS-CoV-2 感染に対して最も脆弱です。 これまでの研究では、免疫不全患者、特に自己免疫不全症候群（AIDS）と診断された患者は感染が長期化するリスクが高いことが示されている。 ただし、これらの研究のほとんどは遡及的であり、ある程度のバイアスがかかっています。
新しい SARS-CoV-2 変異体の伝播は、伝播と宿主クリアランスの確率論的な力学によってほとんど制限されています。 しかし、免疫不全患者における宿主内での複製は、ウイルスが変異を獲得するのに十分な時間を提供する可能性があります。
科学者らは、アルファ（B.1.1.7）変異体やオミクロン（BA.1）変異体などのSARS-CoV-2の懸念される変異体（VOC）は、免疫不全患者の長期感染中に発生したという仮説を立てている。 既存の介入が免疫不全患者における高度に変異したバリアントの進化を減らすか促進するかどうかは依然として不明である。
研究について
免疫不全患者におけるSARS-CoV-2感染に関する緊急の疑問に対処するために、研究者らはSARS-CoV-2オミクロン感染と診断された外来患者と入院患者を対象に前向き調査を実施した。 この前向き多施設研究には、米国の5つの医療センターから成人患者が登録されており、全員が免疫不全状態であり、過去14日間に新型コロナウイルス検査で陽性反応を示した。
鼻検体は収集され、連続検体で陰性が得られるまで、リアルタイム逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）アッセイによって2〜4週間ごとに検査されました。 ウイルス培養と全ゲノム配列決定が陽性検体に対して実行されました。
ウイルス培養物を分析することで、リボ核酸（RNA）が ウイルス量研究者らは、配列データと配列データをもとに、感染が長引くリスクが最も高い個人、抗ウイルス治療の効果、免疫不全集団における SARS-CoV-2 の進化の動態を定義しました。
主な調査結果
中等度から重度の免疫不全状態にあるこの多様なグループでは、SARS-CoV-2感染の長期化はまれでした。 幅広い免疫不全状態において、比較的限定された SARS-CoV-2 の進化が認められました。
短期感染でも長期感染でも、宿主内での進化速度は同様でした。 免疫不全患者の感染期間の長さが主な差別化要因と考えられました。
長期間感染した患者では、ウイルス受容体結合ドメイン (RBD) に変異が蓄積しました。 さらに、現在またはその後の Omicron 系統でいくつかの置換が観察されました。
強力な危険因子に関する調査により、抗 CD20 療法または抗 CD19 療法、骨髄腫、またはリンパ腫によって引き起こされる可能性のある B 細胞の機能不全または枯渇が明らかになりました。 この結果は、長期感染でB細胞の悪性腫瘍が認められた、以前に発表された症例報告と一致しており、SARS-CoV-2の除去における抗体の重要な役割を強調している。
これまでの症例報告では、ヒト免疫不全ウイルス (HIV) 感染症を抱えて生きている人々におけるウイルス複製の長期化が報告されています。 これは、研究対象のエイズ患者のうち、感染期間が200日を超えた1人の患者の経験と一致している。 この患者は、CD4 数が 50 細胞/μL 未満であり、制御されていない HIV 複製を示しました。これは、体液性免疫の障害に起因する可能性もあります。
結論
現在の研究のいくつかの注目すべき限界には、リアルタイム RT-PCR で SARS-CoV-2 陽性反応を示したフォローアップ検体のサンプルサイズが小さいことが含まれており、これによりウイルス進化の関連特性を研究する範囲が制限されていました。 免疫不全の状態に関する潜在的な偏見を軽減するために、定義は意図的に広く保たれました。 ただし、これにより、長期にわたる感染を経験する可能性が低い、軽度から中程度の免疫障害を持つ個人も含まれることになりました。
患者のほぼ 75% には陽性の追跡検体が得られなかったため、2 ～ 4 週間の検体採取頻度は低すぎると考えられます。 この研究のもう 1 つの注目すべき限界は、免疫応答性の対照群が存在しないことでした。 さらに、今回の研究は米国内でのみ実施されたため、結果の一般化可能性が制限されています。
現在の研究では、SARS-CoV-2陽性で免疫不全状態の成人を検討しており、B細胞枯渇と悪性腫瘍の患者では感染期間とウイルスの進化がより顕著であることに注目した。 免疫不全患者における変異はその後の Omicron 変異を強く予測するものではなく、ゲノム監視に基づく代替アプローチが有用である可能性があることを示唆しています。
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2024-02-01 00:10:00
