中国南西部成都における伴侶動物からのコロナウイルスの循環と遺伝的特徴：パンデミック後 1 年

。 2025年10月15日:2025:7589098。土井：10.1155/tbed/7589098。 eコレクション2025。

所属を拡大する

所属

• 1 中国西部公衆衛生学校および中国西部第 4 病院、四川大学、成都 610041、四川省、公衆衛生実験科学部。
• 2 中国江西省贛州341000の贛州人民病院品質管理計画部。

クリップボード内のアイテム

Linxuan Liao et al.トランスバウンド緊急ディス。 2025年。

詳細を表示 表示オプション

表示オプション

要約 PubMed PMID のフォーマット

。 2025年10月15日:2025:7589098。土井：10.1155/tbed/7589098。 eコレクション2025。

所属

• 1 中国西部公衆衛生学校および中国西部第 4 病院、四川大学、成都 610041、四川省、公衆衛生実験科学部。
• 2 中国江西省贛州341000の贛州人民病院品質管理計画部。

クリップボード内のアイテム

全文リンク CiteDisplay オプション

表示オプション

フォーマット AbstractPubMedPMID

抽象的な

キーワード:

コード検出。伴侶動物。コロナウイルス;遺伝的特徴付け。組み換え。

パブメッドの免責事項

利益相反に関する声明

著者は利益相反がないことを宣言します。

数字

図1

推定アミノ酸の頻度…

図1

推定されるアミノ酸変異の頻度 S 、 N 、 ORF3abc …

図1

推定されるアミノ酸変異の頻度 S、 N、 ORF3abc、 そして ORF7ab FCoV および CCoV の遺伝子。 FCoV C1Je (DQ848678.1) 分離株および CCoV K378 (KC175340.1) 分離株を、それぞれ変異の定義のための参照株として使用しました。濃い灰色は FCoV を示し、薄い灰色は CCoV を示します。

図2

部分的なシーケンスのアライメント S …

図2

部分的なシーケンスのアライメント S 同定されたFCoV株と参照間の遺伝子…

図2

部分的なシーケンスのアライメント S 同定された FCoV 株と参照株の間の遺伝子。赤い長方形は、参照株と比較した FCoV の挿入と欠失を示しています。

図3

アミノ酸バリエーションの比較…

図3

アミノ酸変異の比較 FCoVS 遺伝子。同じ色が表示されました…

図3

アミノ酸変異の比較 FCoVS 遺伝子。同じ色は、参照株と比較した変異を示しました。

図4

アミノ酸バリエーションの比較…

図4

アミノ酸変異の比較 CCoVS 遺伝子。同じ色が表示されました…

図4

アミノ酸変異の比較 CCoVS 遺伝子。同じ色は、参照株と比較した変異を示しました。赤で示された文字は、タンパク質内の特定のアミノ酸変異を示します。

図5

FCoV の系統解析と…

図5

完全なデータに基づいた FCoV および CCoV/CRCoV の系統解析 S 遺伝子。 (A)…

図5

完全なデータに基づいた FCoV および CCoV/CRCoV の系統解析 S 遺伝子。 (A) の系統樹 FCoVS 遺伝子; (B) の系統樹 CCoV そして CRCoV S 遺伝子。ブートストラップ値 ≥50% のみが表示されました。赤い点は、この研究で得られた配列を表します。黄色、紫、緑色の三角形は、それぞれ中国 (四川省)、中国 (四川省を除く)、およびその他の国からの参照株を表します。

図6

組換え部位の解析…

図6

の組換え部位の解析 FCoVS 遺伝子。 (A) シムプロット…

図6

の組換え部位の解析 FCoVS 遺伝子。 (A) FCoV-S-(2-8) の SimPlot 類似度 (A1) およびブートスキャン分析 (A2)。図 6A では、FCoV-S-(2-8) 株がクエリ株として指定されました。 (B) FCoV-S-(5-9) の SimPlot 類似性 (B1) およびブートスキャン分析 (B2)。図 6B では、FCoV-S-(5-9) 株がクエリ株として指定されました。組換えブレークポイントは赤い線で示され、その位置は下部に赤でラベル付けされています。類似度 1.0 は、ヌクレオチド配列との 100% の同一性を示します。デフォルト設定として、ウィンドウ サイズ 200 bp、ステップ サイズ 20 bp、および反復回数 100 を使用しました。

参考文献

1. 1. Yang H.、Rao Z. SARS-CoV-2 の構造生物学と治療開発への影響。ネイチャーレビュー 微生物学 。 2021;19(11):685–700。土井: 10.1038/s41579-021-00630-8。 –
      
      土肥
      

      –
      
      PMC
      

      – パブメッド

2. 1. ヴラソワ AN、ディアス A.、ダムティ D. 他東マレーシアの肺炎で入院中の患者から新型イヌコロナウイルスが分離された。臨床感染症。 2022;74(3):446–454。土井：10.1093/cid/ciab456。 –
      
      土肥
      

      –
      
      PMC
      

      – パブメッド

3. 1. レドニッキー JA、タグリアモンテ MS、ホワイト SK、他ハイチへの訪問者からの新しい組換えイヌコロナウイルスの分離：人獣共通感染症由来のコロナウイルスがヒトに伝播するさらなる証拠。臨床感染症。 2022;75(1):e1184–e1187。土井：10.1093/cid/ciab924。 –
      
      土肥
      

      –
      
      PMC
      

      – パブメッド

4. 1. Su S.、Wong G.、Shi W. 他コロナウイルスの疫学、遺伝子組換え、病因。微生物学の動向。 2016;24(6):490–502。土井：10.1016/j.tim.2016.03.003。 –
      
      土肥
      

      –
      
      PMC
      

      – パブメッド

5. 1. Shuid AN、Safi N.、Haghani A.、他。ネコ伝染性腹膜炎ウイルス感染細胞のアポトーシス転写機構。アポトーシス。 2015;20(11):1457–1470。土井: 10.1007/s10495-015-1172-7。 –
      
      土肥
      

      –
      
      PMC
      

      – パブメッド

48 件の参考文献をすべて表示

MeSH 用語

• 猫の病気* / 疫学

• コロナウイルス感染症* / 疫学

• コロナウイルス感染症* / 獣医

• コロナウイルス感染症* / ウイルス学

• コロナウイルス* / 分類

• コロナウイルス* / 分離と精製

• コロナウイルス、犬 / 遺伝学

• コロナウイルス、イヌ / 分離と精製

• コロナウイルス、ネコ科動物 / 遺伝学

• コロナウイルス、ネコ科動物 / 分離と精製

• 犬の病気* / 疫学

• SARS-CoV-2 / 分離と精製

LinkOut – その他のリソース

• 全文ソース

• 研究資料

• その他

#中国南西部成都における伴侶動物からのコロナウイルスの循環と遺伝的特徴パンデミック後 #年