日本語版
最新ニュース
世界

ゲノム解析によりヨーロッパにおけるイベリアアカシカの独自性が確認

個体レベルでの遺伝子構造。クレジット: 分子生態学 (2024年)。 DOI: 10.1111/mec.17508 700頭以上のヨーロッパアカシカのゲノム研究により、ヨーロッパ大陸の4つの分布地域(ノルウェー、スコットランド、スペイン、中央ヨーロッパ)が特定され、それぞれが保存する必要がある独自の遺伝的特徴を持っている。 ヨーロッパ大陸の主要哺乳類の 1 つであるヨーロッパアカシカの現在の分布と起源を DNA から調査するには、この動物の現在の遺伝的状況に基づいて数千年にわたる調査が必要でした。これは、コルドバ大学の狩猟および魚類資源研究ユニット (UIRCP) が調整する 25 人のチームが行ったことです。 研究チームは、ヨーロッパ各地から集められたサンプル中の 736 頭の鹿それぞれから 35,701 個の遺伝子マーカー (SNP) の情報を活用して、鹿の分布の 4 つの主要地域 (ノルウェー、スコットランド、スペイン、中央ヨーロッパ) とその違いを特定し、イベリア半島に生息する鹿の独自性を確認することができました。この個体群は辺境に生息しているため、他の鹿よりも遺伝的多様性が維持されており、適切な管理と保護政策がさらに重要になります。 この研究は、ジャーナルに掲載された。 分子生態学は、集団の現在の遺伝子構造を分析して、さまざまな遺伝子系統が地理的に広がり、現在の構造を形成したプロセスを推測することから成り、系統地理学として知られています。これは、以前に使用されていた方法と比較して DNA から取得できる情報を大幅に拡大したゲノム研究のおかげで可能になりました。 これまでの技術では15~30個のDNAマーカーが分析されていたが、今回の研究では英国で開発されたシカ用のツールが使用され、DNAの特定のポイントにある5万個の遺伝子マーカーを観察できるようになり、シカのゲノムのより正確な画像が得られた。この5万個のポイントは、シカのDNAを構成する約30億個の塩基対に比べるとまだ微々たるものだが、この研究は重要な前進である。 完全なゲノム配列の解析も現在進行中です。これらの最新ツールは、スペインに2つの鹿の系統が存在するという、UIRCPチームが2016年にすでに発表した内容を確認することにも成功しました。この2つの系統は遺伝的によく分化しており、氷河期から続いており、1つはイベリア半島の南中央部に、もう1つは西部に存在しています。 研究チームは、スペインの鹿とともに、ヨーロッパ大陸の他の鹿の個体群も特定した。スコットランドの鹿とノルウェーの鹿は、スペインの鹿と同様に周辺的な個体群である。つまり、よりよく分化した遺伝的特徴を特徴とするが、中央ヨーロッパに対応する個体群は互いに混ざり合ってより均質化している。 流通の歴史 この研究で特定された遺伝的差異と、ミトコンドリアDNA(周期的な突然変異により生物時計の役割を果たす遺伝物質)を分析した以前の研究の差異を合わせると、研究チームは、数千年にわたる4つの主な移動波がスペインの鹿の独自性と大陸の他の地域との関係に貢献し、現在の鹿の分布がどのように形成されたかについての理解を深めることができました。 北ヨーロッパが凍結したため、分布の最初の2つの波(1つは約7万年前の更新世の終わり、もう1つは2万2千年前の最終大氷河期前)で、シカは東ヨーロッパの元の場所から、イギリス南部(現在は海に覆われている地域)とイベリア半島の2つの場所に移動し、最初は西に、次に中央に移動しました。 氷が解けると、シカは北の新たな領域へと拡大しました。約 1…

ゲノム解析によりヨーロッパにおけるイベリアアカシカの独自性が確認

1726073863
2024-09-11 16:56:04

個体レベルでの遺伝子構造。クレジット: 分子生態学 (2024年)。 DOI: 10.1111/mec.17508

700頭以上のヨーロッパアカシカのゲノム研究により、ヨーロッパ大陸の4つの分布地域(ノルウェー、スコットランド、スペイン、中央ヨーロッパ)が特定され、それぞれが保存する必要がある独自の遺伝的特徴を持っている。

ヨーロッパ大陸の主要哺乳類の 1 つであるヨーロッパアカシカの現在の分布と起源を DNA から調査するには、この動物の現在の遺伝的状況に基づいて数千年にわたる調査が必要でした。これは、コルドバ大学の狩猟および魚類資源研究ユニット (UIRCP) が調整する 25 人のチームが行ったことです。

研究チームは、ヨーロッパ各地から集められたサンプル中の 736 頭の鹿それぞれから 35,701 個の遺伝子マーカー (SNP) の情報を活用して、鹿の分布の 4 つの主要地域 (ノルウェー、スコットランド、スペイン、中央ヨーロッパ) とその違いを特定し、イベリア半島に生息する鹿の独自性を確認することができました。この個体群は辺境に生息しているため、他の鹿よりも遺伝的多様性が維持されており、適切な管理と保護政策がさらに重要になります。

この研究は、ジャーナルに掲載された。 分子生態学は、集団の現在の遺伝子構造を分析して、さまざまな遺伝子系統が地理的に広がり、現在の構造を形成したプロセスを推測することから成り、系統地理学として知られています。これは、以前に使用されていた方法と比較して DNA から取得できる情報を大幅に拡大したゲノム研究のおかげで可能になりました。

これまでの技術では15~30個のDNAマーカーが分析されていたが、今回の研究では英国で開発されたシカ用のツールが使用され、DNAの特定のポイントにある5万個の遺伝子マーカーを観察できるようになり、シカのゲノムのより正確な画像が得られた。この5万個のポイントは、シカのDNAを構成する約30億個の塩基対に比べるとまだ微々たるものだが、この研究は重要な前進である。

完全なゲノム配列の解析も現在進行中です。これらの最新ツールは、スペインに2つの鹿の系統が存在するという、UIRCPチームが2016年にすでに発表した内容を確認することにも成功しました。この2つの系統は遺伝的によく分化しており、氷河期から続いており、1つはイベリア半島の南中央部に、もう1つは西部に存在しています。

研究チームは、スペインの鹿とともに、ヨーロッパ大陸の他の鹿の個体群も特定した。スコットランドの鹿とノルウェーの鹿は、スペインの鹿と同様に周辺的な個体群である。つまり、よりよく分化した遺伝的特徴を特徴とするが、中央ヨーロッパに対応する個体群は互いに混ざり合ってより均質化している。

流通の歴史

この研究で特定された遺伝的差異と、ミトコンドリアDNA(周期的な突然変異により生物時計の役割を果たす遺伝物質)を分析した以前の研究の差異を合わせると、研究チームは、数千年にわたる4つの主な移動波がスペインの鹿の独自性と大陸の他の地域との関係に貢献し、現在の鹿の分布がどのように形成されたかについての理解を深めることができました。

北ヨーロッパが凍結したため、分布の最初の2つの波(1つは約7万年前の更新世の終わり、もう1つは2万2千年前の最終大氷河期前)で、シカは東ヨーロッパの元の場所から、イギリス南部(現在は海に覆われている地域)とイベリア半島の2つの場所に移動し、最初は西に、次に中央に移動しました。

氷が解けると、シカは北の新たな領域へと拡大しました。約 1 万年前 (完新世) に、イギリス諸島南部のシカはスコットランドに、中央ヨーロッパのシカはスカンジナビアに、南フランスのシカは大陸中央部に移動しました。後者は、完新世後期 (過去約 4,000 年) に互いに混ざり合いました。

このようにして、シカの現在の分布地域は 4 つに分かれました。まず、中央ヨーロッパ、次に海や山に守られた周辺地域 3 つ、スペイン、スコットランド、ノルウェーです。イベリア半島のシカは、最も長く孤立したままでいる地域です。

「2万年もの間、イベリア半島の鹿は他の鹿と混ざり合ってこなかった」とフアン・カランサは言う。そのため、スペインの鹿は他の地域の鹿とは異なる独自の身体的特徴と求愛の鳴き声を維持している。

さらに、研究で言及されている最初の 2 つの分布の波により、大陸の中央部 (たとえばフランスを含む) の鹿は地理的に近いにもかかわらず、スペインの鹿に遺伝的に最も類似している鹿はスコットランドの鹿である。

保全政策への取り組み

イベリア半島は明らかに2度にわたってシカで埋め尽くされ、異なる特徴を持つ2つの系統が現在の分布を形成しているが、これは近接性や人間の導入によって雑種が生まれていないことを意味するものではない。したがって、チームはスペイン、ノルウェー、スコットランドなどのヨーロッパの周辺地域と2つのスペイン系統の分布地域の両方で、個体群の独自性を維持する適切な管理および保護政策を支持している。

これら 2 つの系統は「2 つの異なる亜種として説明されているわけではありませんが、遺伝学的には保護する価値があるほどの特徴を備えています」とカランサ氏は説明し、「そこに何があり、それがどのように作られたかの歴史がわかれば、それに価値が与えられ、価値を与えることで保存する価値があるのです」と付け加えた。

詳細情報:
Juan Carranza et al、現代のヨーロッパアカシカの遺伝的構造のゲノムワイドSNP評価により、ヨーロッパの周辺集団と主な混合地帯の区別が浮き彫りになった、 分子生態学 (2024年)。 DOI: 10.1111/mec.17508

コルドバ大学提供

引用: ゲノム解析により、ヨーロッパにおけるイベリアアカシカの独自性が確認 (2024年9月11日) 2024年9月11日に https://phys.org/news/2024-09-genomic-analysis-uniqueness-iberian-red.html から取得

この文書は著作権の対象です。個人的な学習や研究を目的とした公正な取り扱いを除き、書面による許可なしに複製することはできません。コンテンツは情報提供のみを目的として提供されています。

#ゲノム解析によりヨーロッパにおけるイベリアアカシカの独自性が確認

執筆者について: nipponese

Nipponese News編集部は、国内外のニュースを日本語で分かりやすくお届けします。