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2024-05-08 11:00:00
研究者らは、単一細胞の空間プロテオミクスのための初の配列決定ベースの光学系を使用しない方法を実証する
ストックホルム、2024 年 5 月 8 日 /PRNewswire/ — ピクセルジェン・テクノロジーズ単一細胞の空間プロテオミクスのリーダーである同社は本日、Pixelgen、カロリンスカ研究所、ロンドンのインペリアル・カレッジ、およびスウェーデン王立工科大学の研究者らが、細胞の相対的な位置を特定するための画期的な配列決定ベースの方法を実証したと発表した。単一細胞内の高度に多重化された免疫学的に関連するタンパク質 査読済み 記事 に発表されました ネイチャーメソッド。 分子ピクセル化 (MPX) テクノロジー この研究で使用されたのは、光を使用しない単一細胞の空間プロテオミクスを初めて実証したもので、プロテオミクスレベルの単一細胞研究において 3D での多重化、スループット、および空間分解能を可能にします。
「分子ピクセル化：シーケンスによる単一細胞の空間プロテオミクス」と題されたこの研究は、免疫細胞受容体の空間タンパク質組織を3Dで特定し視覚化するDNAバーコードベースの戦略の能力を示している。 免疫細胞表面受容体が相互にどのように組織され、その挙動が細胞の重要な機能の多くを制御するか。 研究者は伝統的に、固定化サンプル上で蛍光標識抗体を使用する顕微鏡法やフローサイトメトリーを使用して、表面タンパク質の空間組織化を研究してきました。 これらのアプローチには多重化とサンプル スループットに制限があり、データは 2 次元でのみ視覚化されます。
MPX は、化学的に固定された細胞上のタンパク質標的に結合した DNA タグ付き抗体 (抗体-オリゴヌクレオチド複合体、AOC) を使用して、高度に多重化された方法で細胞表面タンパク質の配置を調査します。 サンプルの固定化や単一細胞の区画化は必要なく、アッセイは標準的な反応チューブで実行されます。 独自のナノサイズの DNA 球体である DNA ピクセルを使用して、隣接する AOC 間の結合を形成し、タンパク質配置の空間分析を可能にします。 次に、生成されたアンプリコンの配列が決定され、リードが計算によって各単一細胞の空間プロテオミクス ネットワークに配置されます。
この研究では、T細胞、NK細胞、B細胞、樹状細胞、単球を対象とした異種80重タンパク質パネルを処理しました。 これは、末梢血単核球 (PBMC) からのタンパク質存在量に関する単一細胞ベースのデータを生成する MPX の能力を実証しました。 また、ケモカイン刺激を受けた T 細胞におけるタンパク質の空間構成の既知および新規パターンも特定されました。 この結果は、MPX が表面タンパク質の空間配置に基づいて細胞の状態を定義できることを示しています。
「この研究は、単一細胞の空間プロテオミクスの重要性を強調しています。これは、細胞の運動性と活性化、薬物の作用機序、空間クラスタリングと細胞間コミュニケーションに基づく薬物標的の発見に新たな洞察をもたらす可能性があります」と述べた。 Pixelgen の最高技術責任者であり、この論文の筆頭著者である Filip Karlsson 氏。 「私たちは、MPXには従来の技術に比べて大きな利点があり、がんのCAR-T細胞の免疫シナプスの事前調整など、免疫調節活動をサポートするために細胞表面タンパク質を空間的に再構成することを目的とした治療法の開発を導く上で重要な役割を果たすと信じています」そしてより広範に、新世代の医薬品と診断への道を切り開きます。」
「この研究で実証されたように、個々の白血球におけるタンパク質の空間分布と共局在を分析できることは、細胞が細胞間相互作用によってどのように制御され、環境要因に応じてその機能を適応させるかについての研究にとって非常に価値があります。」と付け加えた。カロリンスカ研究所およびロンドンのインペリアル・カレッジの小児免疫学の教授であるペッター・ブロディン医学博士は、この論文の共著者でもあります。 「この追加の空間次元は、私たちが研究し慣れているタンパク質とmRNAの存在量の測定に直交する情報層を提供し、それが将来何を教えてくれるのかを知りたいと考えています。」
Pixelgen テクノロジーズについて
Pixelgen Technologies AB は、細胞表面タンパク質とその空間的相互関係をマッピングすることで生物学に新しい空間理解をもたらすというビジョンを持つ、情熱的で経験豊富なイノベーターと起業家のチームによって 2020 年に設立されました。 同社は、細胞表面タンパク質を分析するための DNA ベースの可視化技術である Molecular Pixelation を開発し、より優れた医薬品や診断を進歩させる細胞活動に関する新たな洞察を獲得しました。 Pixelgen はスウェーデンのストックホルムに本社を置いています。
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出典 Pixelgen Technologies
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