腸内微生物叢が HIV リザーバーのダイナミクスをどのように駆動するか

HIV は、胃腸 (GI) 管を含む宿主の免疫系を攻撃し、細胞の損傷、微生物の移動、および炎症を引き起こします。 胃腸管は、患者が抗レトロウイルス療法 (ART) を中止した後の HIV ウイルスのリバウンドの原因となることも知られています。

研究

レトロウイルスと日和見感染に関する最近の第 30 回会議 (CROI 2023) で共有された新しい研究では、組織リザーバー間の HIV ダイナミクスが研究されました。 研究者らは、HIV ウイルスのダイナミクスに関連するバイオマーカー、ウイルス貯留層の特性、およびマイクロバイオームの組成を評価しました。

研究集団には、Last Gift コホートから募集された 8 人の参加者が含まれていました。 参加者はほぼ全員が男性 (n = 7) と白人/白人 (n = 7) でした。

メソッド

調査員は、すべての参加者で HIV フルエンベロープ単一ゲノム シーケンスを実行し、33 の固有の組織 (参加者あたり 10 ～ 25) にわたってデジタル ドロップレット (dd) PCR を介して HIV DNA レベルを測定しました。

これらのモデルを利用して、研究者はサンプリングされた組織間の HIV ダイナミクス、または推定移動イベントの数を推測しました。 彼らは、血漿中の 44 のサイトカインのパネルを測定しました。

マイクロバイオームは、16S-rDNA シーケンスを使用して、GI 組織によって特徴付けられました。 研究者らは、ベイジアン階層モデルを利用して、組織間のウイルス移動と、(1) HIV リザーバー特性、(2) マイクロバイオーム組成、および (3) 可溶性バイオマーカーとの関連性を判断しました。 これらのモデルには、ソース組織とレシピエント組織の予測因子、組織が同じ生物学的システムにあるかどうか、および宿主レベルと組織レベルの影響が含まれていました。

結果

ベイジアン離散特性分析 (DTA) は、消化管組織内、消化管組織からの、または消化管組織へのウイルス移動が、炎症および恒常性のより高いマーカーと関連していることを明らかにしました。 消化管組織に関連するウイルスの移動は、細胞の炎症反応の調節因子である ICAM1 の血中濃度の低下とも相関していました。

DTA は、解剖学的部位でのウイルス集団間の遺伝的距離の低下と、部位間のウイルス移動の増加との間に強い関連性を示しました。 消化管組織の中で、ソース組織とレシピエント組織のウイルスの多様性は、ウイルスの移動と同様に正の相関がありました。

腸内微生物叢では、研究者らは、ウイルスの移動とソース組織のフソバクテリアの存在量とレシピエント組織のアクチノバクテリアとの間の正の関連性に炎症の別のマーカーがあることを確認しました。

結論

研究者らは、彼らの研究がウイルスのダイナミクスに対するHIVリザーバー組成の影響を確認したと判断しました. 「全身性炎症と微生物の腸内環境も HIV ダイナミクスに影響を与えることを示しました」と研究の著者は結論付けています。